Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms