Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMP2A6NFY4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms