Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms