Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms