Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms