Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC162PA2VCL2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms