Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPDC1A2A3K4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPDC1A2A3K4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms