Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCE3A1L190 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms