Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms