Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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