Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Padi1Q9Z185 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Padi1Q9Z185 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Padi1Q9Z185 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Padi1Q9Z185 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Padi1Q9Z185 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Padi1Q9Z185 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Padi1Q9Z185 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Padi1Q9Z185 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Padi1Q9Z185 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Padi1Q9Z185 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Padi1Q9Z185 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Padi1Q9Z185 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Padi1Q9Z185 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Padi1Q9Z185 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Padi1Q9Z185 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Padi1Q9Z185 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Padi1Q9Z185 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Padi1Q9Z185 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Padi1Q9Z185 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Padi1Q9Z185 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Padi1Q9Z185 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Padi1Q9Z185 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Padi1Q9Z185 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Padi1Q9Z185 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Padi1Q9Z185 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Padi1Q9Z185 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Padi1Q9Z185 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Padi1Q9Z185 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Padi1Q9Z185 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Padi1Q9Z185 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Padi1Q9Z185 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Padi1Q9Z185 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Padi1Q9Z185 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Padi1Q9Z185 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Padi1Q9Z185 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Padi1Q9Z185 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Padi1Q9Z185 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Padi1Q9Z185 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Padi1Q9Z185 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Padi1Q9Z185 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Padi1Q9Z185 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Padi1Q9Z185 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Padi1Q9Z185 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Padi1Q9Z185 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Padi1Q9Z185 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Padi1Q9Z185 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Padi1Q9Z185 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Padi1Q9Z185 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Padi1Q9Z185 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Padi1Q9Z185 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Padi1Q9Z185 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Padi1Q9Z185 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Padi1Q9Z185 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Padi1Q9Z185 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Padi1Q9Z185 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Padi1Q9Z185 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Padi1Q9Z185 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Padi1Q9Z185 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Padi1Q9Z185 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Padi1Q9Z185 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Padi1Q9Z185 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Padi1Q9Z185 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Padi1Q9Z185 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Padi1Q9Z185 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Padi1Q9Z185 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Padi1Q9Z185 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Padi1Q9Z185 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Padi1Q9Z185 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Padi1Q9Z185 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Padi1Q9Z185 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Padi1Q9Z185 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Padi1Q9Z185 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Padi1Q9Z185 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Padi1Q9Z185 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Padi1Q9Z185 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Padi1Q9Z185 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Padi1Q9Z185 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Padi1Q9Z185 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Padi1Q9Z185 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Padi1Q9Z185 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Padi1Q9Z185 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Padi1Q9Z185 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Padi1Q9Z185 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Padi1Q9Z185 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Padi1Q9Z185 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Padi1Q9Z185 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Padi1Q9Z185 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms