Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AmfrQ9R049 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AmfrQ9R049 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AmfrQ9R049 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AmfrQ9R049 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AmfrQ9R049 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AmfrQ9R049 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
AmfrQ9R049 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
AmfrQ9R049 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AmfrQ9R049 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AmfrQ9R049 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AmfrQ9R049 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AmfrQ9R049 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
AmfrQ9R049 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AmfrQ9R049 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AmfrQ9R049 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AmfrQ9R049 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AmfrQ9R049 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
AmfrQ9R049 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
AmfrQ9R049 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AmfrQ9R049 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AmfrQ9R049 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AmfrQ9R049 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AmfrQ9R049 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AmfrQ9R049 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AmfrQ9R049 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AmfrQ9R049 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AmfrQ9R049 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AmfrQ9R049 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AmfrQ9R049 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AmfrQ9R049 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AmfrQ9R049 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AmfrQ9R049 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AmfrQ9R049 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AmfrQ9R049 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AmfrQ9R049 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AmfrQ9R049 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AmfrQ9R049 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AmfrQ9R049 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AmfrQ9R049 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AmfrQ9R049 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AmfrQ9R049 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AmfrQ9R049 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AmfrQ9R049 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AmfrQ9R049 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AmfrQ9R049 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AmfrQ9R049 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AmfrQ9R049 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AmfrQ9R049 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AmfrQ9R049 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AmfrQ9R049 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
AmfrQ9R049 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AmfrQ9R049 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AmfrQ9R049 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AmfrQ9R049 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AmfrQ9R049 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AmfrQ9R049 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AmfrQ9R049 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
AmfrQ9R049 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AmfrQ9R049 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AmfrQ9R049 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AmfrQ9R049 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AmfrQ9R049 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AmfrQ9R049 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AmfrQ9R049 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AmfrQ9R049 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AmfrQ9R049 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AmfrQ9R049 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AmfrQ9R049 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AmfrQ9R049 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AmfrQ9R049 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AmfrQ9R049 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AmfrQ9R049 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AmfrQ9R049 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AmfrQ9R049 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AmfrQ9R049 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AmfrQ9R049 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AmfrQ9R049 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AmfrQ9R049 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AmfrQ9R049 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AmfrQ9R049 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AmfrQ9R049 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AmfrQ9R049 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AmfrQ9R049 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AmfrQ9R049 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AmfrQ9R049 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AmfrQ9R049 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AmfrQ9R049 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AmfrQ9R049 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AmfrQ9R049 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AmfrQ9R049 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AmfrQ9R049 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AmfrQ9R049 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AmfrQ9R049 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AmfrQ9R049 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AmfrQ9R049 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AmfrQ9R049 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AmfrQ9R049 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
AmfrQ9R049 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AmfrQ9R049 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms