Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Trp53inp1Q9QXE4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trp53inp1Q9QXE4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trp53inp1Q9QXE4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trp53inp1Q9QXE4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trp53inp1Q9QXE4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trp53inp1Q9QXE4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trp53inp1Q9QXE4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trp53inp1Q9QXE4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trp53inp1Q9QXE4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trp53inp1Q9QXE4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trp53inp1Q9QXE4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trp53inp1Q9QXE4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trp53inp1Q9QXE4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trp53inp1Q9QXE4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trp53inp1Q9QXE4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trp53inp1Q9QXE4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Trp53inp1Q9QXE4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trp53inp1Q9QXE4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trp53inp1Q9QXE4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trp53inp1Q9QXE4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trp53inp1Q9QXE4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trp53inp1Q9QXE4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trp53inp1Q9QXE4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Trp53inp1Q9QXE4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trp53inp1Q9QXE4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trp53inp1Q9QXE4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trp53inp1Q9QXE4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trp53inp1Q9QXE4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trp53inp1Q9QXE4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trp53inp1Q9QXE4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trp53inp1Q9QXE4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trp53inp1Q9QXE4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trp53inp1Q9QXE4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trp53inp1Q9QXE4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trp53inp1Q9QXE4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trp53inp1Q9QXE4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trp53inp1Q9QXE4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trp53inp1Q9QXE4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Trp53inp1Q9QXE4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trp53inp1Q9QXE4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trp53inp1Q9QXE4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trp53inp1Q9QXE4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trp53inp1Q9QXE4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trp53inp1Q9QXE4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Trp53inp1Q9QXE4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trp53inp1Q9QXE4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trp53inp1Q9QXE4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trp53inp1Q9QXE4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trp53inp1Q9QXE4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trp53inp1Q9QXE4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trp53inp1Q9QXE4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trp53inp1Q9QXE4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trp53inp1Q9QXE4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trp53inp1Q9QXE4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trp53inp1Q9QXE4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trp53inp1Q9QXE4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trp53inp1Q9QXE4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trp53inp1Q9QXE4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trp53inp1Q9QXE4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trp53inp1Q9QXE4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trp53inp1Q9QXE4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Trp53inp1Q9QXE4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trp53inp1Q9QXE4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trp53inp1Q9QXE4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trp53inp1Q9QXE4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trp53inp1Q9QXE4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms