RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032080.8

Pradc1-201, Transcript of Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pradc1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa60.62■■■■■ 7.29
Pradc1-201ENSMUST00000032080 NischQ80TM9 1593 aa59.15■■■■■ 7.06
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Abcc9P70170 1546 aa58.51■■■■■ 6.96
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Abcc8B2RUS7 1588 aa57.66■■■■■ 6.82
Pradc1-201ENSMUST00000032080 ScribQ80U72 1612 aa56.75■■■■■ 6.68
Pradc1-201ENSMUST00000032080 NacadQ5SWP3 1504 aa54.58■■■■■ 6.33
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa54.48■■■■■ 6.31
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Kdm5dQ62240 1548 aa54.44■■■■■ 6.3
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Sycp2Q9CUU3 1500 aa53.62■■■■■ 6.17
Pradc1-201ENSMUST00000032080 BicraF8VPZ9 1578 aa53.25■■■■■ 6.12
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Dcaf1Q80TR8 1506 aa52.66■■■■■ 6.02
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP52.32■■■■■ 5.97
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP52■■■■■ 5.92
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa51.46■■■■■ 5.83
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa51.45■■■■■ 5.83
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP51.16■■■■■ 5.78
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Ercc6F8VPZ5 1481 aa50.94■■■■■ 5.75
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Dnajc5P60904 198 aa50.89■■■■■ 5.74
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Fam135aQ6NS59 1506 aa50.73■■■■■ 5.71
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Baz1aO88379 1555 aa50.52■■■■■ 5.68
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Smarca2Q6DIC0 1577 aa50.43■■■■■ 5.66
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Crybg2B7ZCC2 1516 aa50.39■■■■■ 5.66
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP50.23■■■■■ 5.63
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa50.13■■■■■ 5.62
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP50.12■■■■■ 5.61
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Trim41Q5NCC3 630 aa50.12■■■■■ 5.61
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Ccdc180J3QNE4 1664 aa50.09■■■■■ 5.61
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Wdr62Q3U3T8 1523 aa49.95■■■■■ 5.59
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP49.95■■■■■ 5.59
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Frmpd1A2AKB4 1549 aa49.9■■■■■ 5.58
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Baz1bQ9Z277 1479 aa49.86■■■■■ 5.57
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Ubl4bQ9CQ84 188 aa49.66■■■■■ 5.54
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Mrc2Q64449 1479 aa49.57■■■■■ 5.53
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Rhox8Q6VSS7 320 aa49.55■■■■■ 5.52
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa49.55■■■■■ 5.52
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Unc13aQ4KUS2 1712 aa49.25■■■■■ 5.47
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa48.7■■■■■ 5.39
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP48.42■■■■■ 5.34
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Shroom2A2ALU4 1481 aa48.27■■■■■ 5.32
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Kif21aQ9QXL2 1672 aa48.03■■■■■ 5.28
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa48.02■■■■■ 5.28
Pradc1-201ENSMUST00000032080 CftrP26361 1476 aa48.02■■■■■ 5.28
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Col17a1Q07563 1470 aa48.01■■■■■ 5.28
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP47.93■■■■■ 5.26
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Cux2P70298 1426 aa47.92■■■■■ 5.26
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Synj1Q8CHC4 1574 aa47.81■■■■■ 5.24
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Kif15Q6P9L6 1387 aa47.59■■■■■ 5.21
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Top2bQ64511 1612 aa47.48■■■■■ 5.19
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP47.17■■■■■ 5.14
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP47.14■■■■■ 5.14
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Plb1Q3TTY0 1478 aa47■■■■■ 5.11
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Lamc3Q9R0B6 1581 aa46.98■■■■■ 5.11
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Cep164Q5DU05 1446 aa46.96■■■■■ 5.11
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa46.92■■■■■ 5.1
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP46.79■■■■■ 5.08
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa46.7■■■■■ 5.07
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Rusc2Q80U22 1514 aa46.66■■■■■ 5.06
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Rtl1Q7M732 1744 aa46.64■■■■■ 5.06
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa46.56■■■■■ 5.04
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Crocc2F6XLV1 1638 aa46.55■■■■■ 5.04
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Il27Q8K3I6 234 aa46.5■■■■■ 5.03
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Ift140E9PY46 1464 aa46.38■■■■■ 5.01
Pradc1-201ENSMUST00000032080 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa46.34■■■■■ 5.01
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Ccdc18Q640L5 1455 aa46.32■■■■■ 5.01
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Adgrl3Q80TS3 1537 aa46.29■■■■■ 5
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Camsap1A2AHC3 1581 aa46.01■■■■■ 4.96
Pradc1-201ENSMUST00000032080 PtprkP35822 1457 aa45.98■■■■■ 4.95
Pradc1-201ENSMUST00000032080 TnnQ80Z71 1560 aa45.95■■■■■ 4.95
Pradc1-201ENSMUST00000032080 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.95
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Cep170Q6A065 1588 aa45.94■■■■■ 4.94
Pradc1-201ENSMUST00000032080 PtprtQ99M80 1454 aa45.93■■■■■ 4.94
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Gm156Q58A37 223 aa45.88■■■■■ 4.94
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Disp1Q3TDN0 1521 aa45.82■■■■■ 4.93
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa45.8■■■■■ 4.92
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Setd1bQ8CFT2 1985 aa45.76■■■■■ 4.92
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Duox2A2AQ99 1517 aa45.72■■■■■ 4.91
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Golga3P55937 1487 aa45.66■■■■■ 4.9
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa45.64■■■■■ 4.9
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP45.54■■■■■ 4.88
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Pprc1Q6NZN1 1644 aa45.49■■■■■ 4.87
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Fgd6Q69ZL1 1399 aa45.48■■■■■ 4.87
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Samd9lQ69Z37 1561 aa45.43■■■■■ 4.86
Pradc1-201ENSMUST00000032080 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa45.27■■■■■ 4.84
Pradc1-201ENSMUST00000032080 AknaQ80VW7 1404 aa45.26■■■■■ 4.84
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa45.23■■■■■ 4.83
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Abcc1O35379 1528 aa45.22■■■■■ 4.83
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Grin2bQ01097 1482 aa45.2■■■■■ 4.83
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.83
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Rad54l2Q99NG0 1466 aa45.16■■■■■ 4.82
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Grin2aP35436 1464 aa45.11■■■■■ 4.81
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Cngb1E1AZ71 1325 aa45.1■■■■■ 4.81
Pradc1-201ENSMUST00000032080 Magi3Q9EQJ9 1476 aa45.02■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.5 ms