Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpa33Q9JKA5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpa33Q9JKA5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpa33Q9JKA5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpa33Q9JKA5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpa33Q9JKA5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpa33Q9JKA5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpa33Q9JKA5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpa33Q9JKA5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpa33Q9JKA5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpa33Q9JKA5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpa33Q9JKA5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpa33Q9JKA5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpa33Q9JKA5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpa33Q9JKA5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpa33Q9JKA5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpa33Q9JKA5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpa33Q9JKA5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpa33Q9JKA5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpa33Q9JKA5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpa33Q9JKA5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpa33Q9JKA5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpa33Q9JKA5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpa33Q9JKA5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpa33Q9JKA5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpa33Q9JKA5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpa33Q9JKA5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpa33Q9JKA5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpa33Q9JKA5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpa33Q9JKA5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpa33Q9JKA5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpa33Q9JKA5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gpa33Q9JKA5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms