Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI58

Raet1d, Retinoic acid early-inducible protein 1-delta, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raet1dQ9JI58 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Raet1dQ9JI58 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Raet1dQ9JI58 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Raet1dQ9JI58 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Raet1dQ9JI58 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Raet1dQ9JI58 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Raet1dQ9JI58 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Raet1dQ9JI58 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Raet1dQ9JI58 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Raet1dQ9JI58 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Raet1dQ9JI58 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,17■■□□□ 1,46
Raet1dQ9JI58 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Raet1dQ9JI58 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Raet1dQ9JI58 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Raet1dQ9JI58 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Raet1dQ9JI58 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Raet1dQ9JI58 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Raet1dQ9JI58 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Raet1dQ9JI58 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Raet1dQ9JI58 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
Raet1dQ9JI58 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Raet1dQ9JI58 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Raet1dQ9JI58 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Raet1dQ9JI58 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Raet1dQ9JI58 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Raet1dQ9JI58 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Raet1dQ9JI58 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Raet1dQ9JI58 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Raet1dQ9JI58 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Raet1dQ9JI58 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Raet1dQ9JI58 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Raet1dQ9JI58 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Raet1dQ9JI58 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Raet1dQ9JI58 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Raet1dQ9JI58 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Raet1dQ9JI58 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Raet1dQ9JI58 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Raet1dQ9JI58 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Raet1dQ9JI58 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Raet1dQ9JI58 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Raet1dQ9JI58 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Raet1dQ9JI58 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Raet1dQ9JI58 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Raet1dQ9JI58 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Raet1dQ9JI58 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Raet1dQ9JI58 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Raet1dQ9JI58 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Raet1dQ9JI58 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Raet1dQ9JI58 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Raet1dQ9JI58 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Raet1dQ9JI58 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Raet1dQ9JI58 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Raet1dQ9JI58 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Raet1dQ9JI58 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Raet1dQ9JI58 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Raet1dQ9JI58 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Raet1dQ9JI58 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,7■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23,64■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,64■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,64■■□□□ 1,38
Raet1dQ9JI58 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Raet1dQ9JI58 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23,58■■□□□ 1,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms