Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r41Q9EQ44 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r41Q9EQ44 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r41Q9EQ44 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r41Q9EQ44 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r41Q9EQ44 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r41Q9EQ44 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r41Q9EQ44 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r41Q9EQ44 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r41Q9EQ44 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r41Q9EQ44 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r41Q9EQ44 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r41Q9EQ44 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r41Q9EQ44 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r41Q9EQ44 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r41Q9EQ44 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r41Q9EQ44 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r41Q9EQ44 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r41Q9EQ44 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r41Q9EQ44 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r41Q9EQ44 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r41Q9EQ44 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r41Q9EQ44 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r41Q9EQ44 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r41Q9EQ44 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r41Q9EQ44 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r41Q9EQ44 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r41Q9EQ44 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r41Q9EQ44 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r41Q9EQ44 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r41Q9EQ44 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r41Q9EQ44 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r41Q9EQ44 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r41Q9EQ44 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r41Q9EQ44 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r41Q9EQ44 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r41Q9EQ44 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r41Q9EQ44 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r41Q9EQ44 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r41Q9EQ44 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r41Q9EQ44 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r41Q9EQ44 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r41Q9EQ44 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r41Q9EQ44 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r41Q9EQ44 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r41Q9EQ44 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r41Q9EQ44 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r41Q9EQ44 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r41Q9EQ44 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r41Q9EQ44 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r41Q9EQ44 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r41Q9EQ44 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r41Q9EQ44 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r41Q9EQ44 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r41Q9EQ44 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r41Q9EQ44 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r41Q9EQ44 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r41Q9EQ44 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r41Q9EQ44 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r41Q9EQ44 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r41Q9EQ44 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r41Q9EQ44 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r41Q9EQ44 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r41Q9EQ44 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r41Q9EQ44 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r41Q9EQ44 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r41Q9EQ44 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r41Q9EQ44 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r41Q9EQ44 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r41Q9EQ44 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r41Q9EQ44 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r41Q9EQ44 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r41Q9EQ44 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r41Q9EQ44 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r41Q9EQ44 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r41Q9EQ44 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r41Q9EQ44 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r41Q9EQ44 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r41Q9EQ44 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r41Q9EQ44 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r41Q9EQ44 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r41Q9EQ44 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r41Q9EQ44 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r41Q9EQ44 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r41Q9EQ44 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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