Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Vmn1r41Q9EQ44 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vmn1r41Q9EQ44 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vmn1r41Q9EQ44 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vmn1r41Q9EQ44 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vmn1r41Q9EQ44 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vmn1r41Q9EQ44 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Vmn1r41Q9EQ44 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Vmn1r41Q9EQ44 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vmn1r41Q9EQ44 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn1r41Q9EQ44 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vmn1r41Q9EQ44 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Vmn1r41Q9EQ44 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Vmn1r41Q9EQ44 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vmn1r41Q9EQ44 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vmn1r41Q9EQ44 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vmn1r41Q9EQ44 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Vmn1r41Q9EQ44 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vmn1r41Q9EQ44 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r41Q9EQ44 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vmn1r41Q9EQ44 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vmn1r41Q9EQ44 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vmn1r41Q9EQ44 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vmn1r41Q9EQ44 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vmn1r41Q9EQ44 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vmn1r41Q9EQ44 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Vmn1r41Q9EQ44 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vmn1r41Q9EQ44 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r41Q9EQ44 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vmn1r41Q9EQ44 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vmn1r41Q9EQ44 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vmn1r41Q9EQ44 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vmn1r41Q9EQ44 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn1r41Q9EQ44 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r41Q9EQ44 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r41Q9EQ44 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn1r41Q9EQ44 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn1r41Q9EQ44 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn1r41Q9EQ44 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r41Q9EQ44 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r41Q9EQ44 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r41Q9EQ44 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r41Q9EQ44 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r41Q9EQ44 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r41Q9EQ44 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r41Q9EQ44 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r41Q9EQ44 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r41Q9EQ44 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r41Q9EQ44 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r41Q9EQ44 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r41Q9EQ44 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r41Q9EQ44 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r41Q9EQ44 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r41Q9EQ44 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r41Q9EQ44 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r41Q9EQ44 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn1r41Q9EQ44 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r41Q9EQ44 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r41Q9EQ44 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vmn1r41Q9EQ44 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vmn1r41Q9EQ44 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn1r41Q9EQ44 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn1r41Q9EQ44 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn1r41Q9EQ44 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r41Q9EQ44 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r41Q9EQ44 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r41Q9EQ44 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vmn1r41Q9EQ44 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r41Q9EQ44 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r41Q9EQ44 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r41Q9EQ44 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn1r41Q9EQ44 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn1r41Q9EQ44 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r41Q9EQ44 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r41Q9EQ44 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn1r41Q9EQ44 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn1r41Q9EQ44 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r41Q9EQ44 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r41Q9EQ44 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r41Q9EQ44 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r41Q9EQ44 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r41Q9EQ44 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r41Q9EQ44 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r41Q9EQ44 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r41Q9EQ44 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r41Q9EQ44 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r41Q9EQ44 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r41Q9EQ44 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r41Q9EQ44 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r41Q9EQ44 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r41Q9EQ44 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r41Q9EQ44 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r41Q9EQ44 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r41Q9EQ44 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Vmn1r41Q9EQ44 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r41Q9EQ44 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r41Q9EQ44 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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