Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc97Q9DBT3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc97Q9DBT3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc97Q9DBT3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc97Q9DBT3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc97Q9DBT3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc97Q9DBT3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc97Q9DBT3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc97Q9DBT3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc97Q9DBT3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc97Q9DBT3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc97Q9DBT3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc97Q9DBT3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc97Q9DBT3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc97Q9DBT3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc97Q9DBT3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc97Q9DBT3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc97Q9DBT3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc97Q9DBT3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc97Q9DBT3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc97Q9DBT3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc97Q9DBT3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc97Q9DBT3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc97Q9DBT3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc97Q9DBT3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc97Q9DBT3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc97Q9DBT3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc97Q9DBT3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc97Q9DBT3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc97Q9DBT3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc97Q9DBT3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc97Q9DBT3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc97Q9DBT3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc97Q9DBT3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc97Q9DBT3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc97Q9DBT3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc97Q9DBT3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc97Q9DBT3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc97Q9DBT3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc97Q9DBT3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc97Q9DBT3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc97Q9DBT3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc97Q9DBT3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc97Q9DBT3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc97Q9DBT3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc97Q9DBT3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc97Q9DBT3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc97Q9DBT3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc97Q9DBT3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc97Q9DBT3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc97Q9DBT3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc97Q9DBT3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc97Q9DBT3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc97Q9DBT3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc97Q9DBT3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc97Q9DBT3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc97Q9DBT3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc97Q9DBT3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc97Q9DBT3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc97Q9DBT3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc97Q9DBT3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc97Q9DBT3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc97Q9DBT3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc97Q9DBT3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc97Q9DBT3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc97Q9DBT3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc97Q9DBT3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc97Q9DBT3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc97Q9DBT3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc97Q9DBT3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc97Q9DBT3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc97Q9DBT3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc97Q9DBT3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc97Q9DBT3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc97Q9DBT3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc97Q9DBT3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc97Q9DBT3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc97Q9DBT3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc97Q9DBT3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc97Q9DBT3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc97Q9DBT3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc97Q9DBT3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms