Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Krtap5-3Q9D226 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Krtap5-3Q9D226 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Krtap5-3Q9D226 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Krtap5-3Q9D226 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Krtap5-3Q9D226 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Krtap5-3Q9D226 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Krtap5-3Q9D226 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Krtap5-3Q9D226 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Krtap5-3Q9D226 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Krtap5-3Q9D226 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Krtap5-3Q9D226 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Krtap5-3Q9D226 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Krtap5-3Q9D226 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Krtap5-3Q9D226 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Krtap5-3Q9D226 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Krtap5-3Q9D226 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Krtap5-3Q9D226 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Krtap5-3Q9D226 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Krtap5-3Q9D226 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Krtap5-3Q9D226 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Krtap5-3Q9D226 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Krtap5-3Q9D226 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Krtap5-3Q9D226 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Krtap5-3Q9D226 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Krtap5-3Q9D226 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Krtap5-3Q9D226 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Krtap5-3Q9D226 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Krtap5-3Q9D226 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Krtap5-3Q9D226 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Krtap5-3Q9D226 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Krtap5-3Q9D226 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Krtap5-3Q9D226 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Krtap5-3Q9D226 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Krtap5-3Q9D226 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Krtap5-3Q9D226 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Krtap5-3Q9D226 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Krtap5-3Q9D226 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Krtap5-3Q9D226 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Krtap5-3Q9D226 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Krtap5-3Q9D226 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Krtap5-3Q9D226 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Krtap5-3Q9D226 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Krtap5-3Q9D226 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Krtap5-3Q9D226 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Krtap5-3Q9D226 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Krtap5-3Q9D226 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Krtap5-3Q9D226 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Krtap5-3Q9D226 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Krtap5-3Q9D226 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Krtap5-3Q9D226 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Krtap5-3Q9D226 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Krtap5-3Q9D226 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Krtap5-3Q9D226 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Krtap5-3Q9D226 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Krtap5-3Q9D226 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Krtap5-3Q9D226 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Krtap5-3Q9D226 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Krtap5-3Q9D226 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Krtap5-3Q9D226 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Krtap5-3Q9D226 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Krtap5-3Q9D226 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Krtap5-3Q9D226 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Krtap5-3Q9D226 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Krtap5-3Q9D226 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Krtap5-3Q9D226 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Krtap5-3Q9D226 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Krtap5-3Q9D226 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Krtap5-3Q9D226 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Krtap5-3Q9D226 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Krtap5-3Q9D226 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Krtap5-3Q9D226 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Krtap5-3Q9D226 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Krtap5-3Q9D226 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Krtap5-3Q9D226 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Krtap5-3Q9D226 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Krtap5-3Q9D226 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Krtap5-3Q9D226 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Krtap5-3Q9D226 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Krtap5-3Q9D226 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Krtap5-3Q9D226 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Krtap5-3Q9D226 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Krtap5-3Q9D226 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Krtap5-3Q9D226 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Krtap5-3Q9D226 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Krtap5-3Q9D226 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Krtap5-3Q9D226 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Krtap5-3Q9D226 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Krtap5-3Q9D226 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Krtap5-3Q9D226 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
Krtap5-3Q9D226 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Krtap5-3Q9D226 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Krtap5-3Q9D226 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Krtap5-3Q9D226 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Krtap5-3Q9D226 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Krtap5-3Q9D226 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Krtap5-3Q9D226 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Krtap5-3Q9D226 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Krtap5-3Q9D226 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms