Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Ribc1Q9D0B8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Ribc1Q9D0B8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Ribc1Q9D0B8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ribc1Q9D0B8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ribc1Q9D0B8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ribc1Q9D0B8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ribc1Q9D0B8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ribc1Q9D0B8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Ribc1Q9D0B8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ribc1Q9D0B8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ribc1Q9D0B8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ribc1Q9D0B8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Ribc1Q9D0B8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
Ribc1Q9D0B8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Ribc1Q9D0B8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ribc1Q9D0B8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ribc1Q9D0B8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ribc1Q9D0B8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Ribc1Q9D0B8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Ribc1Q9D0B8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ribc1Q9D0B8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ribc1Q9D0B8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ribc1Q9D0B8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Ribc1Q9D0B8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ribc1Q9D0B8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Ribc1Q9D0B8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ribc1Q9D0B8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ribc1Q9D0B8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ribc1Q9D0B8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ribc1Q9D0B8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ribc1Q9D0B8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ribc1Q9D0B8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ribc1Q9D0B8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ribc1Q9D0B8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Ribc1Q9D0B8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Ribc1Q9D0B8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ribc1Q9D0B8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ribc1Q9D0B8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ribc1Q9D0B8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ribc1Q9D0B8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ribc1Q9D0B8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ribc1Q9D0B8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Ribc1Q9D0B8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ribc1Q9D0B8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ribc1Q9D0B8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ribc1Q9D0B8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ribc1Q9D0B8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ribc1Q9D0B8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ribc1Q9D0B8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ribc1Q9D0B8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ribc1Q9D0B8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ribc1Q9D0B8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ribc1Q9D0B8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Ribc1Q9D0B8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ribc1Q9D0B8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Ribc1Q9D0B8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ribc1Q9D0B8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ribc1Q9D0B8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ribc1Q9D0B8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ribc1Q9D0B8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ribc1Q9D0B8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ribc1Q9D0B8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ribc1Q9D0B8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ribc1Q9D0B8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ribc1Q9D0B8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ribc1Q9D0B8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ribc1Q9D0B8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Ribc1Q9D0B8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ribc1Q9D0B8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Ribc1Q9D0B8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Ribc1Q9D0B8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Ribc1Q9D0B8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ribc1Q9D0B8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ribc1Q9D0B8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ribc1Q9D0B8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ribc1Q9D0B8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Ribc1Q9D0B8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ribc1Q9D0B8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ribc1Q9D0B8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ribc1Q9D0B8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ribc1Q9D0B8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ribc1Q9D0B8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Ribc1Q9D0B8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Ribc1Q9D0B8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Ribc1Q9D0B8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ribc1Q9D0B8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ribc1Q9D0B8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ribc1Q9D0B8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ribc1Q9D0B8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ribc1Q9D0B8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ribc1Q9D0B8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ribc1Q9D0B8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ribc1Q9D0B8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ribc1Q9D0B8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ribc1Q9D0B8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ribc1Q9D0B8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ribc1Q9D0B8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ribc1Q9D0B8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ribc1Q9D0B8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,6 ms