Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc77Q9CZH8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc77Q9CZH8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc77Q9CZH8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc77Q9CZH8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc77Q9CZH8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc77Q9CZH8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc77Q9CZH8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc77Q9CZH8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc77Q9CZH8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc77Q9CZH8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc77Q9CZH8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc77Q9CZH8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc77Q9CZH8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc77Q9CZH8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc77Q9CZH8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc77Q9CZH8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc77Q9CZH8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc77Q9CZH8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc77Q9CZH8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc77Q9CZH8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc77Q9CZH8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc77Q9CZH8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc77Q9CZH8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc77Q9CZH8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc77Q9CZH8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc77Q9CZH8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc77Q9CZH8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc77Q9CZH8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc77Q9CZH8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc77Q9CZH8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc77Q9CZH8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc77Q9CZH8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc77Q9CZH8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc77Q9CZH8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc77Q9CZH8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc77Q9CZH8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc77Q9CZH8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc77Q9CZH8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc77Q9CZH8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc77Q9CZH8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc77Q9CZH8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc77Q9CZH8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc77Q9CZH8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc77Q9CZH8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc77Q9CZH8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc77Q9CZH8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc77Q9CZH8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc77Q9CZH8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc77Q9CZH8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc77Q9CZH8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc77Q9CZH8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc77Q9CZH8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc77Q9CZH8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc77Q9CZH8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc77Q9CZH8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc77Q9CZH8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc77Q9CZH8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc77Q9CZH8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc77Q9CZH8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc77Q9CZH8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc77Q9CZH8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc77Q9CZH8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc77Q9CZH8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc77Q9CZH8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc77Q9CZH8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc77Q9CZH8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc77Q9CZH8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc77Q9CZH8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc77Q9CZH8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc77Q9CZH8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc77Q9CZH8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc77Q9CZH8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc77Q9CZH8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc77Q9CZH8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc77Q9CZH8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc77Q9CZH8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc77Q9CZH8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc77Q9CZH8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms