Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mis12Q9CY25 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Mis12Q9CY25 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mis12Q9CY25 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Mis12Q9CY25 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mis12Q9CY25 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mis12Q9CY25 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mis12Q9CY25 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mis12Q9CY25 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mis12Q9CY25 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mis12Q9CY25 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mis12Q9CY25 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mis12Q9CY25 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mis12Q9CY25 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mis12Q9CY25 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Mis12Q9CY25 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mis12Q9CY25 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mis12Q9CY25 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mis12Q9CY25 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Mis12Q9CY25 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mis12Q9CY25 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mis12Q9CY25 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mis12Q9CY25 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Mis12Q9CY25 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mis12Q9CY25 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mis12Q9CY25 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mis12Q9CY25 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mis12Q9CY25 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mis12Q9CY25 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mis12Q9CY25 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mis12Q9CY25 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mis12Q9CY25 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mis12Q9CY25 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mis12Q9CY25 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Mis12Q9CY25 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mis12Q9CY25 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mis12Q9CY25 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mis12Q9CY25 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mis12Q9CY25 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mis12Q9CY25 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mis12Q9CY25 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Mis12Q9CY25 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mis12Q9CY25 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mis12Q9CY25 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mis12Q9CY25 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mis12Q9CY25 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mis12Q9CY25 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mis12Q9CY25 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mis12Q9CY25 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Mis12Q9CY25 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mis12Q9CY25 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mis12Q9CY25 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mis12Q9CY25 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mis12Q9CY25 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mis12Q9CY25 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mis12Q9CY25 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mis12Q9CY25 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Mis12Q9CY25 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mis12Q9CY25 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Mis12Q9CY25 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mis12Q9CY25 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mis12Q9CY25 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mis12Q9CY25 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mis12Q9CY25 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mis12Q9CY25 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mis12Q9CY25 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mis12Q9CY25 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mis12Q9CY25 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mis12Q9CY25 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mis12Q9CY25 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mis12Q9CY25 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mis12Q9CY25 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mis12Q9CY25 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mis12Q9CY25 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mis12Q9CY25 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mis12Q9CY25 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mis12Q9CY25 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mis12Q9CY25 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mis12Q9CY25 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mis12Q9CY25 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mis12Q9CY25 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mis12Q9CY25 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mis12Q9CY25 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mis12Q9CY25 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mis12Q9CY25 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mis12Q9CY25 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mis12Q9CY25 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mis12Q9CY25 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms