Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt12.2□□□□□ -0.461e-23■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.87□□□□□ -0.511e-23■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 PPOX-207ENST00000468968 904 ntTSL 522.64■■□□□ 1.211e-23■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 PPOX-208ENST00000470607 965 ntTSL 320.46■□□□□ 0.871e-23■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 PPOX-210ENST00000490768 1056 ntTSL 318.88■□□□□ 0.611e-23■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 PPOX-209ENST00000479246 963 ntTSL 317.44■□□□□ 0.381e-23■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 THOC6-208ENST00000574957 1143 ntTSL 1 (best)25.15■■□□□ 1.626e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 WDR74-203ENST00000453708 617 ntTSL 223.1■■□□□ 1.296e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 WDR74-217ENST00000545112 788 ntTSL 222.76■■□□□ 1.236e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 WDR74-210ENST00000538277 565 ntTSL 422.04■■□□□ 1.126e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 THOC6-206ENST00000574498 788 ntTSL 321.21■□□□□ 0.996e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 DNAJC17-203ENST00000558769 462 ntTSL 420.37■□□□□ 0.856e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 THOC6-204ENST00000571057 988 ntTSL 1 (best)19.93■□□□□ 0.786e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 WDR74-211ENST00000540620 984 ntTSL 319.65■□□□□ 0.746e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 DNAJC17-205ENST00000559310 792 ntTSL 1 (best)19.18■□□□□ 0.666e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 DNAJC17-207ENST00000560301 987 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.66e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 DNAJC17-204ENST00000559238 1341 ntTSL 518.62■□□□□ 0.576e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 THOC6-203ENST00000571046 614 ntTSL 217.78■□□□□ 0.446e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 NUP214-207ENST00000476004 502 ntTSL 317.76■□□□□ 0.433e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 TRPV1-205ENST00000570742 492 ntTSL 317.51■□□□□ 0.396e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 MICALL2-213ENST00000490608 631 ntTSL 217.03■□□□□ 0.326e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 NUP214-219ENST00000528406 393 ntTSL 315.72■□□□□ 0.113e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 NUP214-211ENST00000498010 483 ntTSL 514.86□□□□□ -0.032e-14■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 DNAJC17-208ENST00000560645 903 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.036e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BUB1-203ENST00000420328 566 ntTSL 514.46□□□□□ -0.096e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BUB1-206ENST00000465029 1999 ntTSL 214.18□□□□□ -0.146e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.176e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 DNAJC17-209ENST00000561018 880 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.26e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 DNAJC17-206ENST00000560065 704 ntTSL 513.24□□□□□ -0.296e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BPNT1-207ENST00000482136 546 ntTSL 312.41□□□□□ -0.426e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 DNAJC17-201ENST00000220496 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.536e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BPNT1-201ENST00000322067 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.646e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BPNT1-202ENST00000354807 1152 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.656e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 NUP214-210ENST00000496921 2977 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.682e-14■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BPNT1-203ENST00000414869 2357 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.716e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BPNT1-210ENST00000544404 2379 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.736e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BPNT1-205ENST00000469520 2737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.826e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BPNT1-209ENST00000498791 559 ntTSL 39.82□□□□□ -0.846e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BPNT1-204ENST00000463953 644 ntTSL 38.76□□□□□ -1.016e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BUB1-205ENST00000447014 551 ntTSL 48.51□□□□□ -1.056e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.074e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BPNT1-206ENST00000480959 583 ntTSL 48.14□□□□□ -1.116e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BPNT1-211ENST00000548668 637 ntTSL 37.42□□□□□ -1.226e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 BPNT1-208ENST00000498237 569 ntTSL 36.77□□□□□ -1.336e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 FAF1-204ENST00000487898 681 ntTSL 35.27□□□□□ -1.576e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 HACE1-203ENST00000369127 5318 ntTSL 1 (best)3.48□□□□□ -1.856e-10■■■■■ 47.8
BUD13Q9BRD0 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.234e-14■■■■■ 47.4
BUD13Q9BRD0 C8orf59-211ENST00000615071 344 ntTSL 25.99□□□□□ -1.454e-14■■■■■ 47.4
BUD13Q9BRD0 GIT1-202ENST00000335356 660 ntTSL 333.17■■■□□ 2.98e-10■■■■■ 47
BUD13Q9BRD0 SAT2-210ENST00000575114 803 ntTSL 225.97■■□□□ 1.756e-15■■■■■ 47
BUD13Q9BRD0 SAT2-209ENST00000573930 711 ntTSL 325.06■■□□□ 1.66e-15■■■■■ 47
BUD13Q9BRD0 GIT1-213ENST00000583413 546 ntTSL 416.37■□□□□ 0.218e-10■■■■■ 47
BUD13Q9BRD0 GIT1-206ENST00000577466 547 ntTSL 213.99□□□□□ -0.178e-10■■■■■ 47
BUD13Q9BRD0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.283e-13■■■■■ 46.8
BUD13Q9BRD0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.273e-13■■■■■ 46.8
BUD13Q9BRD0 MXRA8-206ENST00000473097 975 ntTSL 320.95■□□□□ 0.943e-13■■■■■ 46.8
BUD13Q9BRD0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.723e-13■■■■■ 46.8
BUD13Q9BRD0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.73e-13■■■■■ 46.8
BUD13Q9BRD0 MXRA8-210ENST00000478517 846 ntTSL 318.33■□□□□ 0.523e-13■■■■■ 46.8
BUD13Q9BRD0 MXRA8-208ENST00000476718 1001 ntTSL 317.74■□□□□ 0.433e-13■■■■■ 46.8
BUD13Q9BRD0 MXRA8-207ENST00000474033 1171 ntTSL 1 (best)15.9■□□□□ 0.143e-13■■■■■ 46.8
BUD13Q9BRD0 TOMM40-204ENST00000589253 207 ntTSL 313.67□□□□□ -0.222e-18■■■■■ 46.6
BUD13Q9BRD0 ZNF316-203ENST00000614588 939 ntTSL 324.29■■□□□ 1.481e-7■■■■■ 46.5
BUD13Q9BRD0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 46.5
BUD13Q9BRD0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-9■■■■■ 46.5
BUD13Q9BRD0 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.271e-9■■■■■ 46.5
BUD13Q9BRD0 LRBA-211ENST00000513021 568 ntTSL 410.04□□□□□ -0.82e-18■■■■■ 46.5
BUD13Q9BRD0 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 317.95■□□□□ 0.461e-15■■■■■ 46
BUD13Q9BRD0 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.151e-15■■■■■ 46
BUD13Q9BRD0 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.561e-15■■■■■ 46
BUD13Q9BRD0 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.61e-15■■■■■ 46
BUD13Q9BRD0 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.171e-15■■■■■ 46
BUD13Q9BRD0 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.391e-15■■■■■ 46
BUD13Q9BRD0 PPFIA4-211ENST00000600426 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.77□□□□□ -0.26e-8■■■■■ 45.9
BUD13Q9BRD0 GATM-204ENST00000558118 554 ntTSL 426.32■■□□□ 1.82e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.692e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.142e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-220ENST00000515508 563 ntTSL 221.82■■□□□ 1.082e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.912e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.912e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 DUT-204ENST00000558472 724 ntTSL 320.73■□□□□ 0.912e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 DUT-206ENST00000558978 1171 ntTSL 320.63■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-205ENST00000466514 2199 ntTSL 219.68■□□□□ 0.742e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.732e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-213ENST00000482309 1994 ntTSL 219.59■□□□□ 0.732e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.662e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-218ENST00000489192 762 ntTSL 519.07■□□□□ 0.642e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-215ENST00000509765 613 ntTSL 218.69■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 PPFIA4-213ENST00000601609 558 ntTSL 218.08■□□□□ 0.481e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 GATM-205ENST00000558163 569 ntTSL 417.71■□□□□ 0.432e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 HILPDA-204ENST00000481454 1370 ntTSL 217.53■□□□□ 0.42e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-204ENST00000502385 574 ntTSL 417.01■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.282e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 KMT2B-202ENST00000585476 2864 ntTSL 1 (best)16.78■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-218ENST00000513080 575 ntTSL 416.63■□□□□ 0.252e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 HILPDA-203ENST00000466473 904 ntTSL 516.47■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 45.2
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 2088.7 ms