Protein–RNA interactions for Protein: Q99M15

Pstpip2, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pstpip2Q99M15 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pstpip2Q99M15 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pstpip2Q99M15 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pstpip2Q99M15 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pstpip2Q99M15 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pstpip2Q99M15 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Pstpip2Q99M15 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pstpip2Q99M15 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pstpip2Q99M15 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pstpip2Q99M15 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pstpip2Q99M15 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pstpip2Q99M15 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pstpip2Q99M15 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pstpip2Q99M15 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pstpip2Q99M15 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pstpip2Q99M15 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pstpip2Q99M15 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pstpip2Q99M15 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pstpip2Q99M15 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Pstpip2Q99M15 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pstpip2Q99M15 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pstpip2Q99M15 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Pstpip2Q99M15 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pstpip2Q99M15 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pstpip2Q99M15 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pstpip2Q99M15 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pstpip2Q99M15 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pstpip2Q99M15 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pstpip2Q99M15 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pstpip2Q99M15 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pstpip2Q99M15 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pstpip2Q99M15 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pstpip2Q99M15 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pstpip2Q99M15 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pstpip2Q99M15 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Pstpip2Q99M15 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pstpip2Q99M15 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pstpip2Q99M15 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pstpip2Q99M15 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pstpip2Q99M15 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pstpip2Q99M15 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pstpip2Q99M15 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pstpip2Q99M15 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pstpip2Q99M15 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pstpip2Q99M15 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pstpip2Q99M15 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pstpip2Q99M15 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pstpip2Q99M15 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pstpip2Q99M15 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pstpip2Q99M15 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pstpip2Q99M15 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pstpip2Q99M15 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pstpip2Q99M15 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pstpip2Q99M15 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pstpip2Q99M15 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pstpip2Q99M15 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pstpip2Q99M15 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pstpip2Q99M15 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pstpip2Q99M15 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pstpip2Q99M15 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pstpip2Q99M15 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pstpip2Q99M15 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pstpip2Q99M15 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pstpip2Q99M15 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pstpip2Q99M15 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pstpip2Q99M15 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pstpip2Q99M15 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pstpip2Q99M15 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pstpip2Q99M15 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pstpip2Q99M15 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pstpip2Q99M15 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pstpip2Q99M15 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Pstpip2Q99M15 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pstpip2Q99M15 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pstpip2Q99M15 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pstpip2Q99M15 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pstpip2Q99M15 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pstpip2Q99M15 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pstpip2Q99M15 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pstpip2Q99M15 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pstpip2Q99M15 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pstpip2Q99M15 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pstpip2Q99M15 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pstpip2Q99M15 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pstpip2Q99M15 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pstpip2Q99M15 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pstpip2Q99M15 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pstpip2Q99M15 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pstpip2Q99M15 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pstpip2Q99M15 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pstpip2Q99M15 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Pstpip2Q99M15 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pstpip2Q99M15 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pstpip2Q99M15 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pstpip2Q99M15 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pstpip2Q99M15 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pstpip2Q99M15 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pstpip2Q99M15 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pstpip2Q99M15 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pstpip2Q99M15 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms