Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dhx58Q99J87 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dhx58Q99J87 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dhx58Q99J87 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dhx58Q99J87 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dhx58Q99J87 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dhx58Q99J87 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dhx58Q99J87 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dhx58Q99J87 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dhx58Q99J87 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Dhx58Q99J87 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dhx58Q99J87 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dhx58Q99J87 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dhx58Q99J87 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Dhx58Q99J87 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dhx58Q99J87 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dhx58Q99J87 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Dhx58Q99J87 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dhx58Q99J87 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dhx58Q99J87 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dhx58Q99J87 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dhx58Q99J87 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dhx58Q99J87 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dhx58Q99J87 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dhx58Q99J87 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dhx58Q99J87 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dhx58Q99J87 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dhx58Q99J87 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dhx58Q99J87 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Dhx58Q99J87 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dhx58Q99J87 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dhx58Q99J87 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dhx58Q99J87 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dhx58Q99J87 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dhx58Q99J87 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dhx58Q99J87 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Dhx58Q99J87 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dhx58Q99J87 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dhx58Q99J87 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Dhx58Q99J87 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dhx58Q99J87 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dhx58Q99J87 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dhx58Q99J87 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dhx58Q99J87 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dhx58Q99J87 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dhx58Q99J87 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dhx58Q99J87 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dhx58Q99J87 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dhx58Q99J87 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dhx58Q99J87 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dhx58Q99J87 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dhx58Q99J87 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dhx58Q99J87 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dhx58Q99J87 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dhx58Q99J87 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dhx58Q99J87 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dhx58Q99J87 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dhx58Q99J87 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dhx58Q99J87 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dhx58Q99J87 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dhx58Q99J87 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dhx58Q99J87 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dhx58Q99J87 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dhx58Q99J87 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dhx58Q99J87 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dhx58Q99J87 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dhx58Q99J87 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dhx58Q99J87 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dhx58Q99J87 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dhx58Q99J87 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dhx58Q99J87 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dhx58Q99J87 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dhx58Q99J87 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dhx58Q99J87 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dhx58Q99J87 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dhx58Q99J87 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dhx58Q99J87 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dhx58Q99J87 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dhx58Q99J87 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dhx58Q99J87 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dhx58Q99J87 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dhx58Q99J87 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dhx58Q99J87 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dhx58Q99J87 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Dhx58Q99J87 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dhx58Q99J87 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dhx58Q99J87 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Dhx58Q99J87 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms