Protein–RNA interactions for Protein: Q99222

AFI1, ARF3-interacting protein 1, yeastyeast

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Length 893 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AFI1Q99222 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.17□□□□□ -0.62
AFI1Q99222 CRR1YLR213C 1269 nt11.17□□□□□ -0.62
AFI1Q99222 TAD3YLR316C 969 nt11.16□□□□□ -0.62
AFI1Q99222 YDR094WYDR094W 336 nt11.15□□□□□ -0.62
AFI1Q99222 YFL067WYFL067W 528 nt11.13□□□□□ -0.63
AFI1Q99222 PTK1YKL198C 1989 nt11.13□□□□□ -0.63
AFI1Q99222 DDR2YOL052C-A 186 nt11.12□□□□□ -0.63
AFI1Q99222 SPC25YER018C 666 nt11.11□□□□□ -0.63
AFI1Q99222 STB1YNL309W 1263 nt11.11□□□□□ -0.63
AFI1Q99222 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.08□□□□□ -0.64
AFI1Q99222 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.07□□□□□ -0.64
AFI1Q99222 GPI16YHR188C 1833 nt11.05□□□□□ -0.64
AFI1Q99222 CCT4YDL143W 1587 nt11.05□□□□□ -0.64
AFI1Q99222 HEM12YDR047W 1089 nt11.05□□□□□ -0.64
AFI1Q99222 SNG1YGR197C 1644 nt11.05□□□□□ -0.64
AFI1Q99222 ANP1YEL036C 1503 nt11.04□□□□□ -0.64
AFI1Q99222 MIC10YCL057C-A 294 nt11.04□□□□□ -0.64
AFI1Q99222 VPS60YDR486C 690 nt11.01□□□□□ -0.65
AFI1Q99222 YFR018CYFR018C 1092 nt11.01□□□□□ -0.65
AFI1Q99222 BDH1YAL060W 1149 nt11□□□□□ -0.65
AFI1Q99222 FEN2YCR028C 1539 nt10.99□□□□□ -0.65
AFI1Q99222 SWC5YBR231C 912 nt10.97□□□□□ -0.65
AFI1Q99222 ALG3YBL082C 1377 nt10.96□□□□□ -0.65
AFI1Q99222 YSP3YOR003W 1437 nt10.95□□□□□ -0.66
AFI1Q99222 YLR415CYLR415C 339 nt10.95□□□□□ -0.66
AFI1Q99222 PRE6YOL038W 765 nt10.93□□□□□ -0.66
AFI1Q99222 YFL054CYFL054C 1941 nt10.93□□□□□ -0.66
AFI1Q99222 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.92□□□□□ -0.66
AFI1Q99222 PEX25YPL112C 1185 nt10.92□□□□□ -0.66
AFI1Q99222 YFL066CYFL066C 1179 nt10.89□□□□□ -0.67
AFI1Q99222 YIR016WYIR016W 798 nt10.89□□□□□ -0.67
AFI1Q99222 PAU16YKL224C 372 nt10.88□□□□□ -0.67
AFI1Q99222 RRT5YFR032C 870 nt10.87□□□□□ -0.67
AFI1Q99222 YNL115CYNL115C 1935 nt10.87□□□□□ -0.67
AFI1Q99222 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.84□□□□□ -0.67
AFI1Q99222 RAX1YOR301W 1308 nt10.83□□□□□ -0.68
AFI1Q99222 SPT8YLR055C 1809 nt10.82□□□□□ -0.68
AFI1Q99222 BNA2YJR078W 1362 nt10.81□□□□□ -0.68
AFI1Q99222 MIC12YBR262C 321 nt10.81□□□□□ -0.68
AFI1Q99222 VPS75YNL246W 795 nt10.74□□□□□ -0.69
AFI1Q99222 TIM17YJL143W 477 nt10.72□□□□□ -0.69
AFI1Q99222 XDJ1YLR090W 1380 nt10.71□□□□□ -0.69
AFI1Q99222 SWE1YJL187C 2460 nt10.7□□□□□ -0.7
AFI1Q99222 SHM2YLR058C 1410 nt10.7□□□□□ -0.7
AFI1Q99222 YJL225CYJL225C 5277 nt10.7□□□□□ -0.7
AFI1Q99222 HHO1YPL127C 777 nt10.69□□□□□ -0.7
AFI1Q99222 YGR201CYGR201C 678 nt10.67□□□□□ -0.7
AFI1Q99222 CCA1YER168C 1641 nt10.66□□□□□ -0.7
AFI1Q99222 GDH3YAL062W 1374 nt10.65□□□□□ -0.71
AFI1Q99222 MIR1YJR077C 936 nt10.63□□□□□ -0.71
AFI1Q99222 NIT1YIL164C 600 nt10.61□□□□□ -0.71
AFI1Q99222 NAT4YMR069W 858 nt10.61□□□□□ -0.71
AFI1Q99222 AGP1YCL025C 1902 nt10.6□□□□□ -0.71
AFI1Q99222 GLK1YCL040W 1503 nt10.6□□□□□ -0.71
AFI1Q99222 THI74YDR438W 1113 nt10.57□□□□□ -0.72
AFI1Q99222 PAU7YAR020C 168 nt10.57□□□□□ -0.72
AFI1Q99222 SGT2YOR007C 1041 nt10.57□□□□□ -0.72
AFI1Q99222 AVT6YER119C 1347 nt10.56□□□□□ -0.72
AFI1Q99222 MSF1YPR047W 1410 nt10.54□□□□□ -0.72
AFI1Q99222 GOR1YNL274C 1053 nt10.52□□□□□ -0.73
AFI1Q99222 DUT1YBR252W 444 nt10.51□□□□□ -0.73
AFI1Q99222 SHB17YKR043C 816 nt10.5□□□□□ -0.73
AFI1Q99222 DAT1YML113W 747 nt10.5□□□□□ -0.73
AFI1Q99222 UBA4YHR111W 1323 nt10.47□□□□□ -0.73
AFI1Q99222 YDR010CYDR010C 333 nt10.46□□□□□ -0.73
AFI1Q99222 SBA1YKL117W 651 nt10.44□□□□□ -0.74
AFI1Q99222 DUS1YML080W 1272 nt10.43□□□□□ -0.74
AFI1Q99222 YCR102CYCR102C 1107 nt10.41□□□□□ -0.74
AFI1Q99222 YSR3YKR053C 1215 nt10.39□□□□□ -0.75
AFI1Q99222 RET2YFR051C 1641 nt10.38□□□□□ -0.75
AFI1Q99222 YGL034CYGL034C 366 nt10.38□□□□□ -0.75
AFI1Q99222 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.38□□□□□ -0.75
AFI1Q99222 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.38□□□□□ -0.75
AFI1Q99222 YCL074WYCL074W 927 nt10.36□□□□□ -0.75
AFI1Q99222 STR3YGL184C 1398 nt10.36□□□□□ -0.75
AFI1Q99222 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.35□□□□□ -0.75
AFI1Q99222 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.35□□□□□ -0.75
AFI1Q99222 FUR4YBR021W 1902 nt10.35□□□□□ -0.75
AFI1Q99222 PHO89YBR296C 1725 nt10.34□□□□□ -0.75
AFI1Q99222 UME6YDR207C 2511 nt10.34□□□□□ -0.75
AFI1Q99222 NBP35YGL091C 987 nt10.32□□□□□ -0.76
AFI1Q99222 XYL2YLR070C 1071 nt10.32□□□□□ -0.76
AFI1Q99222 AQY2YLL052C 450 nt10.31□□□□□ -0.76
AFI1Q99222 YCR087WYCR087W 516 nt10.29□□□□□ -0.76
AFI1Q99222 SFA1YDL168W 1161 nt10.28□□□□□ -0.76
AFI1Q99222 BOR1YNL275W 1731 nt10.27□□□□□ -0.77
AFI1Q99222 TIR3YIL011W 810 nt10.24□□□□□ -0.77
AFI1Q99222 SHH4YLR164W 507 nt10.24□□□□□ -0.77
AFI1Q99222 RBG1YAL036C 1110 nt10.23□□□□□ -0.77
AFI1Q99222 COQ2YNR041C 1119 nt10.23□□□□□ -0.77
AFI1Q99222 AIM45YPR004C 1035 nt10.23□□□□□ -0.77
AFI1Q99222 MRP20YDR405W 792 nt10.22□□□□□ -0.77
AFI1Q99222 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.22□□□□□ -0.77
AFI1Q99222 NDI1YML120C 1542 nt10.2□□□□□ -0.78
AFI1Q99222 HSP60YLR259C 1719 nt10.19□□□□□ -0.78
AFI1Q99222 LSC2YGR244C 1284 nt10.16□□□□□ -0.78
AFI1Q99222 POM34YLR018C 900 nt10.16□□□□□ -0.78
AFI1Q99222 GLR1YPL091W 1452 nt10.16□□□□□ -0.78
AFI1Q99222 RTN2YDL204W 1182 nt10.15□□□□□ -0.78
AFI1Q99222 YMR244WYMR244W 1068 nt10.15□□□□□ -0.78
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