Protein–RNA interactions for Protein: Q91V17

Znrf1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf1Q91V17 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf1Q91V17 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf1Q91V17 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf1Q91V17 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znrf1Q91V17 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znrf1Q91V17 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf1Q91V17 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf1Q91V17 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf1Q91V17 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf1Q91V17 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf1Q91V17 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znrf1Q91V17 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf1Q91V17 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf1Q91V17 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf1Q91V17 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znrf1Q91V17 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf1Q91V17 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf1Q91V17 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Znrf1Q91V17 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znrf1Q91V17 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Znrf1Q91V17 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znrf1Q91V17 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znrf1Q91V17 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znrf1Q91V17 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znrf1Q91V17 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znrf1Q91V17 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Znrf1Q91V17 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znrf1Q91V17 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znrf1Q91V17 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znrf1Q91V17 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znrf1Q91V17 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znrf1Q91V17 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znrf1Q91V17 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znrf1Q91V17 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znrf1Q91V17 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znrf1Q91V17 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znrf1Q91V17 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znrf1Q91V17 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znrf1Q91V17 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znrf1Q91V17 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Znrf1Q91V17 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znrf1Q91V17 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znrf1Q91V17 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znrf1Q91V17 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znrf1Q91V17 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znrf1Q91V17 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znrf1Q91V17 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znrf1Q91V17 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znrf1Q91V17 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znrf1Q91V17 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znrf1Q91V17 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znrf1Q91V17 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znrf1Q91V17 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znrf1Q91V17 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf1Q91V17 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf1Q91V17 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf1Q91V17 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf1Q91V17 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf1Q91V17 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znrf1Q91V17 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znrf1Q91V17 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf1Q91V17 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf1Q91V17 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf1Q91V17 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf1Q91V17 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf1Q91V17 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf1Q91V17 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf1Q91V17 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf1Q91V17 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znrf1Q91V17 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znrf1Q91V17 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf1Q91V17 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms