Protein–RNA interactions for Protein: Q8R493

Chrnb4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb4Q8R493 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrnb4Q8R493 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrnb4Q8R493 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrnb4Q8R493 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrnb4Q8R493 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrnb4Q8R493 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrnb4Q8R493 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrnb4Q8R493 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrnb4Q8R493 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrnb4Q8R493 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrnb4Q8R493 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrnb4Q8R493 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrnb4Q8R493 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrnb4Q8R493 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrnb4Q8R493 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb4Q8R493 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb4Q8R493 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb4Q8R493 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrnb4Q8R493 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrnb4Q8R493 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrnb4Q8R493 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrnb4Q8R493 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrnb4Q8R493 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrnb4Q8R493 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrnb4Q8R493 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrnb4Q8R493 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrnb4Q8R493 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrnb4Q8R493 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrnb4Q8R493 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrnb4Q8R493 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrnb4Q8R493 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrnb4Q8R493 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrnb4Q8R493 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrnb4Q8R493 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrnb4Q8R493 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrnb4Q8R493 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrnb4Q8R493 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrnb4Q8R493 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrnb4Q8R493 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrnb4Q8R493 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrnb4Q8R493 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrnb4Q8R493 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrnb4Q8R493 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrnb4Q8R493 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrnb4Q8R493 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrnb4Q8R493 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrnb4Q8R493 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrnb4Q8R493 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrnb4Q8R493 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrnb4Q8R493 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrnb4Q8R493 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrnb4Q8R493 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrnb4Q8R493 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrnb4Q8R493 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrnb4Q8R493 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrnb4Q8R493 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrnb4Q8R493 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrnb4Q8R493 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrnb4Q8R493 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrnb4Q8R493 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrnb4Q8R493 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrnb4Q8R493 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrnb4Q8R493 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrnb4Q8R493 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrnb4Q8R493 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrnb4Q8R493 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrnb4Q8R493 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrnb4Q8R493 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrnb4Q8R493 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrnb4Q8R493 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrnb4Q8R493 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrnb4Q8R493 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrnb4Q8R493 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrnb4Q8R493 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrnb4Q8R493 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrnb4Q8R493 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrnb4Q8R493 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrnb4Q8R493 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrnb4Q8R493 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chrnb4Q8R493 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrnb4Q8R493 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrnb4Q8R493 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrnb4Q8R493 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrnb4Q8R493 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms