Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVIPQ8NHG7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVIPQ8NHG7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVIPQ8NHG7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVIPQ8NHG7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVIPQ8NHG7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVIPQ8NHG7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVIPQ8NHG7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVIPQ8NHG7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVIPQ8NHG7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVIPQ8NHG7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVIPQ8NHG7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVIPQ8NHG7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVIPQ8NHG7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SVIPQ8NHG7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVIPQ8NHG7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVIPQ8NHG7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVIPQ8NHG7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVIPQ8NHG7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVIPQ8NHG7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVIPQ8NHG7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVIPQ8NHG7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVIPQ8NHG7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SVIPQ8NHG7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVIPQ8NHG7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVIPQ8NHG7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVIPQ8NHG7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVIPQ8NHG7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVIPQ8NHG7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVIPQ8NHG7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVIPQ8NHG7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVIPQ8NHG7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVIPQ8NHG7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVIPQ8NHG7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVIPQ8NHG7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVIPQ8NHG7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVIPQ8NHG7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVIPQ8NHG7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SVIPQ8NHG7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVIPQ8NHG7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVIPQ8NHG7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVIPQ8NHG7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVIPQ8NHG7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SVIPQ8NHG7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVIPQ8NHG7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVIPQ8NHG7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVIPQ8NHG7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVIPQ8NHG7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVIPQ8NHG7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVIPQ8NHG7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVIPQ8NHG7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVIPQ8NHG7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVIPQ8NHG7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVIPQ8NHG7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVIPQ8NHG7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVIPQ8NHG7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVIPQ8NHG7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms