Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE6

Slc38a2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a2Q8CFE6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a2Q8CFE6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a2Q8CFE6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a2Q8CFE6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a2Q8CFE6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc38a2Q8CFE6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc38a2Q8CFE6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc38a2Q8CFE6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc38a2Q8CFE6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a2Q8CFE6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a2Q8CFE6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a2Q8CFE6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a2Q8CFE6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a2Q8CFE6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a2Q8CFE6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a2Q8CFE6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a2Q8CFE6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a2Q8CFE6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a2Q8CFE6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a2Q8CFE6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a2Q8CFE6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a2Q8CFE6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a2Q8CFE6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a2Q8CFE6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a2Q8CFE6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a2Q8CFE6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a2Q8CFE6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a2Q8CFE6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a2Q8CFE6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc38a2Q8CFE6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a2Q8CFE6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a2Q8CFE6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a2Q8CFE6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a2Q8CFE6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a2Q8CFE6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a2Q8CFE6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a2Q8CFE6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a2Q8CFE6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc38a2Q8CFE6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a2Q8CFE6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a2Q8CFE6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a2Q8CFE6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a2Q8CFE6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a2Q8CFE6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a2Q8CFE6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a2Q8CFE6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a2Q8CFE6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a2Q8CFE6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a2Q8CFE6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a2Q8CFE6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a2Q8CFE6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc38a2Q8CFE6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a2Q8CFE6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a2Q8CFE6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a2Q8CFE6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a2Q8CFE6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a2Q8CFE6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a2Q8CFE6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a2Q8CFE6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a2Q8CFE6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a2Q8CFE6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc38a2Q8CFE6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a2Q8CFE6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a2Q8CFE6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a2Q8CFE6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a2Q8CFE6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a2Q8CFE6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a2Q8CFE6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a2Q8CFE6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a2Q8CFE6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a2Q8CFE6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a2Q8CFE6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a2Q8CFE6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a2Q8CFE6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a2Q8CFE6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a2Q8CFE6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a2Q8CFE6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc38a2Q8CFE6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc38a2Q8CFE6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc38a2Q8CFE6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc38a2Q8CFE6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc38a2Q8CFE6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc38a2Q8CFE6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc38a2Q8CFE6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc38a2Q8CFE6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc38a2Q8CFE6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc38a2Q8CFE6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc38a2Q8CFE6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc38a2Q8CFE6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc38a2Q8CFE6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc38a2Q8CFE6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc38a2Q8CFE6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc38a2Q8CFE6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc38a2Q8CFE6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc38a2Q8CFE6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc38a2Q8CFE6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc38a2Q8CFE6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc38a2Q8CFE6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc38a2Q8CFE6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc38a2Q8CFE6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms