Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Apol9bQ8C7I4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apol9bQ8C7I4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apol9bQ8C7I4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apol9bQ8C7I4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Apol9bQ8C7I4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apol9bQ8C7I4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apol9bQ8C7I4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apol9bQ8C7I4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apol9bQ8C7I4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apol9bQ8C7I4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apol9bQ8C7I4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apol9bQ8C7I4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apol9bQ8C7I4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apol9bQ8C7I4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apol9bQ8C7I4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apol9bQ8C7I4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Apol9bQ8C7I4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apol9bQ8C7I4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apol9bQ8C7I4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apol9bQ8C7I4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apol9bQ8C7I4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apol9bQ8C7I4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apol9bQ8C7I4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apol9bQ8C7I4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apol9bQ8C7I4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apol9bQ8C7I4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Apol9bQ8C7I4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apol9bQ8C7I4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apol9bQ8C7I4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apol9bQ8C7I4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apol9bQ8C7I4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Apol9bQ8C7I4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apol9bQ8C7I4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apol9bQ8C7I4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Apol9bQ8C7I4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apol9bQ8C7I4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apol9bQ8C7I4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apol9bQ8C7I4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apol9bQ8C7I4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apol9bQ8C7I4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apol9bQ8C7I4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apol9bQ8C7I4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apol9bQ8C7I4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apol9bQ8C7I4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apol9bQ8C7I4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apol9bQ8C7I4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apol9bQ8C7I4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apol9bQ8C7I4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apol9bQ8C7I4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apol9bQ8C7I4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apol9bQ8C7I4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apol9bQ8C7I4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apol9bQ8C7I4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apol9bQ8C7I4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apol9bQ8C7I4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apol9bQ8C7I4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apol9bQ8C7I4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apol9bQ8C7I4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Apol9bQ8C7I4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apol9bQ8C7I4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apol9bQ8C7I4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apol9bQ8C7I4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apol9bQ8C7I4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apol9bQ8C7I4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apol9bQ8C7I4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apol9bQ8C7I4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apol9bQ8C7I4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apol9bQ8C7I4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apol9bQ8C7I4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apol9bQ8C7I4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apol9bQ8C7I4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apol9bQ8C7I4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apol9bQ8C7I4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apol9bQ8C7I4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apol9bQ8C7I4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apol9bQ8C7I4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apol9bQ8C7I4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apol9bQ8C7I4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apol9bQ8C7I4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apol9bQ8C7I4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apol9bQ8C7I4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apol9bQ8C7I4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Apol9bQ8C7I4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apol9bQ8C7I4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apol9bQ8C7I4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apol9bQ8C7I4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apol9bQ8C7I4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms