Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf18Q8BM39 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf18Q8BM39 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf18Q8BM39 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf18Q8BM39 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf18Q8BM39 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf18Q8BM39 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf18Q8BM39 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf18Q8BM39 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf18Q8BM39 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf18Q8BM39 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf18Q8BM39 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf18Q8BM39 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf18Q8BM39 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf18Q8BM39 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf18Q8BM39 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf18Q8BM39 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf18Q8BM39 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf18Q8BM39 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf18Q8BM39 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf18Q8BM39 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf18Q8BM39 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf18Q8BM39 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf18Q8BM39 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf18Q8BM39 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf18Q8BM39 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf18Q8BM39 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf18Q8BM39 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf18Q8BM39 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf18Q8BM39 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf18Q8BM39 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf18Q8BM39 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf18Q8BM39 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf18Q8BM39 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf18Q8BM39 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf18Q8BM39 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf18Q8BM39 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf18Q8BM39 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf18Q8BM39 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf18Q8BM39 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf18Q8BM39 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf18Q8BM39 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf18Q8BM39 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf18Q8BM39 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf18Q8BM39 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf18Q8BM39 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf18Q8BM39 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf18Q8BM39 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf18Q8BM39 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf18Q8BM39 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf18Q8BM39 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf18Q8BM39 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf18Q8BM39 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf18Q8BM39 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf18Q8BM39 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf18Q8BM39 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf18Q8BM39 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf18Q8BM39 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prpf18Q8BM39 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prpf18Q8BM39 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf18Q8BM39 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf18Q8BM39 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf18Q8BM39 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf18Q8BM39 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf18Q8BM39 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf18Q8BM39 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf18Q8BM39 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf18Q8BM39 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf18Q8BM39 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf18Q8BM39 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf18Q8BM39 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf18Q8BM39 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf18Q8BM39 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf18Q8BM39 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf18Q8BM39 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf18Q8BM39 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf18Q8BM39 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf18Q8BM39 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf18Q8BM39 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf18Q8BM39 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf18Q8BM39 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf18Q8BM39 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf18Q8BM39 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms