Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
Ubash3bQ8BGG7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Ubash3bQ8BGG7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Ubash3bQ8BGG7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Ubash3bQ8BGG7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Ubash3bQ8BGG7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Ubash3bQ8BGG7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Ubash3bQ8BGG7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ubash3bQ8BGG7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ubash3bQ8BGG7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ubash3bQ8BGG7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ubash3bQ8BGG7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ubash3bQ8BGG7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,14■■□□□ 1,45
Ubash3bQ8BGG7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ubash3bQ8BGG7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ubash3bQ8BGG7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Ubash3bQ8BGG7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,13■■□□□ 1,45
Ubash3bQ8BGG7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ubash3bQ8BGG7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Ubash3bQ8BGG7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Ubash3bQ8BGG7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Ubash3bQ8BGG7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Ubash3bQ8BGG7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ubash3bQ8BGG7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ubash3bQ8BGG7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Ubash3bQ8BGG7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Ubash3bQ8BGG7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ubash3bQ8BGG7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,01■■□□□ 1,43
Ubash3bQ8BGG7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ubash3bQ8BGG7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Ubash3bQ8BGG7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Ubash3bQ8BGG7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Ubash3bQ8BGG7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,96■■□□□ 1,43
Ubash3bQ8BGG7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ubash3bQ8BGG7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Ubash3bQ8BGG7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Ubash3bQ8BGG7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Ubash3bQ8BGG7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Ubash3bQ8BGG7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Ubash3bQ8BGG7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ubash3bQ8BGG7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ubash3bQ8BGG7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ubash3bQ8BGG7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Ubash3bQ8BGG7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ubash3bQ8BGG7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Ubash3bQ8BGG7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ubash3bQ8BGG7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ubash3bQ8BGG7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ubash3bQ8BGG7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ubash3bQ8BGG7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ubash3bQ8BGG7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ubash3bQ8BGG7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
Ubash3bQ8BGG7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ubash3bQ8BGG7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Ubash3bQ8BGG7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ubash3bQ8BGG7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ubash3bQ8BGG7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ubash3bQ8BGG7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ubash3bQ8BGG7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ubash3bQ8BGG7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ubash3bQ8BGG7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ubash3bQ8BGG7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ubash3bQ8BGG7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Ubash3bQ8BGG7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ubash3bQ8BGG7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ubash3bQ8BGG7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ubash3bQ8BGG7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ubash3bQ8BGG7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ubash3bQ8BGG7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ubash3bQ8BGG7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ubash3bQ8BGG7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ubash3bQ8BGG7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ubash3bQ8BGG7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Ubash3bQ8BGG7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ubash3bQ8BGG7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ubash3bQ8BGG7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ubash3bQ8BGG7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ubash3bQ8BGG7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Ubash3bQ8BGG7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Ubash3bQ8BGG7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Ubash3bQ8BGG7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Ubash3bQ8BGG7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Ubash3bQ8BGG7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Ubash3bQ8BGG7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ubash3bQ8BGG7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ubash3bQ8BGG7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
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