Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Ubash3bQ8BGG7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ubash3bQ8BGG7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ubash3bQ8BGG7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ubash3bQ8BGG7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ubash3bQ8BGG7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ubash3bQ8BGG7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubash3bQ8BGG7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ubash3bQ8BGG7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubash3bQ8BGG7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ubash3bQ8BGG7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubash3bQ8BGG7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ubash3bQ8BGG7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubash3bQ8BGG7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubash3bQ8BGG7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubash3bQ8BGG7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubash3bQ8BGG7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubash3bQ8BGG7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubash3bQ8BGG7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubash3bQ8BGG7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ubash3bQ8BGG7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubash3bQ8BGG7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubash3bQ8BGG7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubash3bQ8BGG7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubash3bQ8BGG7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubash3bQ8BGG7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ubash3bQ8BGG7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubash3bQ8BGG7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubash3bQ8BGG7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubash3bQ8BGG7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubash3bQ8BGG7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ubash3bQ8BGG7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubash3bQ8BGG7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubash3bQ8BGG7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubash3bQ8BGG7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubash3bQ8BGG7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubash3bQ8BGG7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubash3bQ8BGG7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubash3bQ8BGG7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubash3bQ8BGG7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubash3bQ8BGG7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubash3bQ8BGG7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubash3bQ8BGG7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubash3bQ8BGG7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubash3bQ8BGG7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubash3bQ8BGG7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ubash3bQ8BGG7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubash3bQ8BGG7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubash3bQ8BGG7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubash3bQ8BGG7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubash3bQ8BGG7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ubash3bQ8BGG7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ubash3bQ8BGG7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubash3bQ8BGG7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubash3bQ8BGG7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubash3bQ8BGG7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubash3bQ8BGG7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubash3bQ8BGG7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubash3bQ8BGG7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubash3bQ8BGG7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubash3bQ8BGG7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubash3bQ8BGG7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubash3bQ8BGG7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubash3bQ8BGG7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubash3bQ8BGG7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubash3bQ8BGG7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubash3bQ8BGG7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubash3bQ8BGG7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubash3bQ8BGG7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubash3bQ8BGG7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubash3bQ8BGG7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubash3bQ8BGG7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubash3bQ8BGG7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubash3bQ8BGG7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubash3bQ8BGG7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubash3bQ8BGG7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubash3bQ8BGG7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubash3bQ8BGG7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubash3bQ8BGG7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubash3bQ8BGG7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubash3bQ8BGG7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubash3bQ8BGG7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubash3bQ8BGG7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubash3bQ8BGG7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubash3bQ8BGG7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubash3bQ8BGG7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubash3bQ8BGG7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms