Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Katnb1Q8BG40 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Katnb1Q8BG40 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Katnb1Q8BG40 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Katnb1Q8BG40 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Katnb1Q8BG40 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Katnb1Q8BG40 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Katnb1Q8BG40 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Katnb1Q8BG40 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Katnb1Q8BG40 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Katnb1Q8BG40 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Katnb1Q8BG40 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Katnb1Q8BG40 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Katnb1Q8BG40 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Katnb1Q8BG40 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Katnb1Q8BG40 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Katnb1Q8BG40 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Katnb1Q8BG40 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Katnb1Q8BG40 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Katnb1Q8BG40 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Katnb1Q8BG40 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Katnb1Q8BG40 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Katnb1Q8BG40 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Katnb1Q8BG40 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Katnb1Q8BG40 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Katnb1Q8BG40 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Katnb1Q8BG40 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Katnb1Q8BG40 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Katnb1Q8BG40 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Katnb1Q8BG40 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Katnb1Q8BG40 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Katnb1Q8BG40 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Katnb1Q8BG40 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Katnb1Q8BG40 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Katnb1Q8BG40 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Katnb1Q8BG40 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Katnb1Q8BG40 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Katnb1Q8BG40 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Katnb1Q8BG40 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Katnb1Q8BG40 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Katnb1Q8BG40 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Katnb1Q8BG40 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Katnb1Q8BG40 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Katnb1Q8BG40 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Katnb1Q8BG40 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Katnb1Q8BG40 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Katnb1Q8BG40 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Katnb1Q8BG40 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Katnb1Q8BG40 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Katnb1Q8BG40 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Katnb1Q8BG40 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Katnb1Q8BG40 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Katnb1Q8BG40 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Katnb1Q8BG40 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Katnb1Q8BG40 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Katnb1Q8BG40 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Katnb1Q8BG40 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Katnb1Q8BG40 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Katnb1Q8BG40 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Katnb1Q8BG40 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Katnb1Q8BG40 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Katnb1Q8BG40 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Katnb1Q8BG40 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Katnb1Q8BG40 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Katnb1Q8BG40 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Katnb1Q8BG40 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Katnb1Q8BG40 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms