Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Katnb1Q8BG40 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Katnb1Q8BG40 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Katnb1Q8BG40 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Katnb1Q8BG40 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Katnb1Q8BG40 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Katnb1Q8BG40 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Katnb1Q8BG40 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Katnb1Q8BG40 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Katnb1Q8BG40 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Katnb1Q8BG40 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Katnb1Q8BG40 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Katnb1Q8BG40 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Katnb1Q8BG40 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Katnb1Q8BG40 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Katnb1Q8BG40 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Katnb1Q8BG40 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Katnb1Q8BG40 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Katnb1Q8BG40 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Katnb1Q8BG40 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Katnb1Q8BG40 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Katnb1Q8BG40 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Katnb1Q8BG40 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Katnb1Q8BG40 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Katnb1Q8BG40 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Katnb1Q8BG40 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Katnb1Q8BG40 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Katnb1Q8BG40 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Katnb1Q8BG40 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Katnb1Q8BG40 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Katnb1Q8BG40 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Katnb1Q8BG40 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Katnb1Q8BG40 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Katnb1Q8BG40 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Katnb1Q8BG40 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Katnb1Q8BG40 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Katnb1Q8BG40 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Katnb1Q8BG40 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Katnb1Q8BG40 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Katnb1Q8BG40 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Katnb1Q8BG40 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Katnb1Q8BG40 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Katnb1Q8BG40 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Katnb1Q8BG40 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Katnb1Q8BG40 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Katnb1Q8BG40 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Katnb1Q8BG40 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Katnb1Q8BG40 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Katnb1Q8BG40 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Katnb1Q8BG40 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Katnb1Q8BG40 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Katnb1Q8BG40 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Katnb1Q8BG40 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Katnb1Q8BG40 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Katnb1Q8BG40 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Katnb1Q8BG40 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Katnb1Q8BG40 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Katnb1Q8BG40 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Katnb1Q8BG40 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Katnb1Q8BG40 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Katnb1Q8BG40 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Katnb1Q8BG40 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Katnb1Q8BG40 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Katnb1Q8BG40 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Katnb1Q8BG40 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Katnb1Q8BG40 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Katnb1Q8BG40 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Katnb1Q8BG40 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Katnb1Q8BG40 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Katnb1Q8BG40 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Katnb1Q8BG40 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Katnb1Q8BG40 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Katnb1Q8BG40 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Katnb1Q8BG40 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Katnb1Q8BG40 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Katnb1Q8BG40 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Katnb1Q8BG40 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Katnb1Q8BG40 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Katnb1Q8BG40 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Katnb1Q8BG40 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Katnb1Q8BG40 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Katnb1Q8BG40 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Katnb1Q8BG40 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Katnb1Q8BG40 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Katnb1Q8BG40 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Katnb1Q8BG40 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Katnb1Q8BG40 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Katnb1Q8BG40 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Katnb1Q8BG40 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Katnb1Q8BG40 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Katnb1Q8BG40 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Katnb1Q8BG40 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Katnb1Q8BG40 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Katnb1Q8BG40 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Katnb1Q8BG40 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Katnb1Q8BG40 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Katnb1Q8BG40 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Katnb1Q8BG40 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Katnb1Q8BG40 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Katnb1Q8BG40 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms