Protein–RNA interactions for Protein: Q86U42

PABPN1, Polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1Q86U42 RAB11FIP3-204ENST00000449879 580 ntTSL 334.49■■■■□ 3.111e-8■■■■■ 32.8
PABPN1Q86U42 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 532.88■■■□□ 2.851e-8■■■■■ 32.8
PABPN1Q86U42 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.31e-7■■■■■ 32.7
PABPN1Q86U42 RCN3-205ENST00000598833 607 ntTSL 332.8■■■□□ 2.841e-7■■■■■ 32.7
PABPN1Q86U42 POLE-204ENST00000441786 556 ntTSL 537.02■■■■□ 3.522e-6■■■■■ 32.6
PABPN1Q86U42 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 32.6
PABPN1Q86U42 NOP2-217ENST00000544630 657 ntTSL 331.95■■■□□ 2.716e-9■■■■■ 32.5
PABPN1Q86U42 TMEM74B-203ENST00000481747 582 ntTSL 256.14■■■■■ 6.583e-9■■■■■ 32.5
PABPN1Q86U42 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.633e-9■■■■■ 32.5
PABPN1Q86U42 TMEM74B-202ENST00000429036 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 330.27■■■□□ 2.443e-9■■■■■ 32.5
PABPN1Q86U42 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.263e-9■■■■■ 32.5
PABPN1Q86U42 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.753e-9■■■■■ 32.5
PABPN1Q86U42 CARS2-205ENST00000480437 486 ntTSL 239.6■■■■□ 3.937e-9■■■■■ 32.4
PABPN1Q86U42 CARS2-204ENST00000471986 218 ntTSL 532.47■■■□□ 2.797e-9■■■■■ 32.4
PABPN1Q86U42 FUS-204ENST00000483853 778 ntTSL 244.15■■■■■ 4.668e-14■■■■■ 32.3
PABPN1Q86U42 EHBP1L1-203ENST00000527214 543 ntTSL 241.5■■■■■ 4.231e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 EHBP1L1-205ENST00000529099 490 ntTSL 541.5■■■■■ 4.231e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 EHBP1L1-206ENST00000529596 799 ntTSL 540.93■■■■■ 4.141e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 EHBP1L1-204ENST00000529056 461 ntTSL 240.48■■■■■ 4.071e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 EHBP1L1-209ENST00000533364 769 ntTSL 239.78■■■■□ 3.961e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.071e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.891e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.781e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.741e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.721e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 TSTA3-207ENST00000527677 541 ntTSL 231.5■■■□□ 2.633e-7■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 TSTA3-202ENST00000524719 762 ntTSL 328.93■■■□□ 2.223e-7■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 PDLIM7-212ENST00000504380 556 ntTSL 225.43■■□□□ 1.661e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 PDLIM7-214ENST00000505746 405 ntTSL 524.92■■□□□ 1.581e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 PSMC5-206ENST00000579708 558 ntTSL 422.14■■□□□ 1.131e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 ZNF789-212ENST00000494186 411 ntTSL 221.89■■□□□ 1.091e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 PSMC5-211ENST00000581842 809 ntTSL 520.93■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 KNTC1-213ENST00000542727 203 ntTSL 39.28□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 32.2
PABPN1Q86U42 POLE-211ENST00000538196 551 ntTSL 426.11■■□□□ 1.771e-6■■■■■ 32.1
PABPN1Q86U42 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.263e-7■■■■■ 31.8
PABPN1Q86U42 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.93e-7■■■■■ 31.8
PABPN1Q86U42 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.823e-7■■■■■ 31.8
PABPN1Q86U42 RARRES2-204ENST00000478771 1907 ntTSL 234.6■■■■□ 3.133e-7■■■■■ 31.8
PABPN1Q86U42 RARRES2-203ENST00000467793 583 ntTSL 333.37■■■□□ 2.933e-7■■■■■ 31.8
PABPN1Q86U42 PSMC5-210ENST00000581764 2107 ntTSL 531.12■■■□□ 2.572e-8■■■■■ 31.7
PABPN1Q86U42 PSMC5-213ENST00000582130 828 ntTSL 330.41■■■□□ 2.462e-8■■■■■ 31.7
PABPN1Q86U42 PSMC5-216ENST00000584320 804 ntTSL 527.93■■■□□ 2.062e-8■■■■■ 31.7
PABPN1Q86U42 PSMC5-220ENST00000585123 899 ntTSL 527.07■■□□□ 1.922e-8■■■■■ 31.7
PABPN1Q86U42 FTCD-205ENST00000446405 436 ntTSL 338.85■■■■□ 3.813e-13■■■■■ 31.5
PABPN1Q86U42 COL7A1-206ENST00000466591 778 ntTSL 235.93■■■■□ 3.348e-7■■■■■ 31.4
PABPN1Q86U42 MAN2C1-213ENST00000563528 367 ntTSL 329.72■■■□□ 2.351e-8■■■■■ 31.4
PABPN1Q86U42 QTRT1-207ENST00000589488 1571 ntTSL 541.56■■■■■ 4.241e-7■■■■■ 31.3
PABPN1Q86U42 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.111e-7■■■■■ 31.3
PABPN1Q86U42 QTRT1-202ENST00000421333 1502 ntTSL 236.44■■■■□ 3.421e-7■■■■■ 31.3
PABPN1Q86U42 QTRT1-204ENST00000587500 540 ntTSL 234.04■■■■□ 3.041e-7■■■■■ 31.3
PABPN1Q86U42 QTRT1-206ENST00000587861 2034 ntTSL 230.7■■■□□ 2.511e-7■■■■■ 31.3
PABPN1Q86U42 QTRT1-212ENST00000592531 370 ntTSL 224.14■■□□□ 1.451e-7■■■■■ 31.3
PABPN1Q86U42 QTRT1-211ENST00000592376 500 ntTSL 322.65■■□□□ 1.221e-7■■■■■ 31.3
PABPN1Q86U42 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.22e-8■■■■■ 31.1
PABPN1Q86U42 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.242e-8■■■■■ 31.1
PABPN1Q86U42 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.152e-8■■■■■ 31.1
PABPN1Q86U42 TBCD-225ENST00000576996 827 ntTSL 530.22■■■□□ 2.432e-8■■■■■ 31.1
PABPN1Q86U42 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.432e-8■■■■■ 31.1
PABPN1Q86U42 TBCD-214ENST00000574801 586 ntTSL 426.03■■□□□ 1.762e-8■■■■■ 31.1
PABPN1Q86U42 SH3GLB2-211ENST00000479237 2794 ntTSL 1 (best)25.19■■□□□ 1.622e-8■■■■■ 31.1
PABPN1Q86U42 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.592e-8■■■■■ 31.1
PABPN1Q86U42 SH3GLB2-209ENST00000461811 4828 ntTSL 1 (best)20.15■□□□□ 0.822e-8■■■■■ 31.1
PABPN1Q86U42 POLE-220ENST00000544692 2221 ntTSL 534.14■■■■□ 3.067e-7■■■■■ 31.1
PABPN1Q86U42 ZBTB48-204ENST00000466813 790 ntTSL 339.9■■■■□ 3.981e-8■■■■■ 30.6
PABPN1Q86U42 ZBTB48-205ENST00000466941 523 ntTSL 235.04■■■■□ 3.21e-8■■■■■ 30.6
PABPN1Q86U42 WDR74-213ENST00000542347 988 ntTSL 234.49■■■■□ 3.111e-8■■■■■ 30.6
PABPN1Q86U42 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.51e-8■■■■■ 30.6
PABPN1Q86U42 ZBTB48-206ENST00000482360 2484 ntTSL 1 (best)25.17■■□□□ 1.621e-8■■■■■ 30.6
PABPN1Q86U42 ZBTB48-208ENST00000498342 2461 ntTSL 224.84■■□□□ 1.571e-8■■■■■ 30.6
PABPN1Q86U42 CCDC162P-213ENST00000638844 2926 ntTSL 519.55■□□□□ 0.721e-8■■■■■ 30.6
PABPN1Q86U42 CCDC162P-201ENST00000368965 929 ntTSL 512.77□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 30.6
PABPN1Q86U42 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC11.4□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 30.6
PABPN1Q86U42 NBEAL2-209ENST00000476095 959 ntTSL 532.85■■■□□ 2.851e-6■■■■■ 30.6
PABPN1Q86U42 FUS-212ENST00000569760 639 ntTSL 248.05■■■■■ 5.288e-12■■■■■ 30.4
PABPN1Q86U42 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.452e-9■■■■■ 30.4
PABPN1Q86U42 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.452e-9■■■■■ 30.4
PABPN1Q86U42 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.332e-9■■■■■ 30.4
PABPN1Q86U42 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.312e-9■■■■■ 30.4
PABPN1Q86U42 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.252e-9■■■■■ 30.4
PABPN1Q86U42 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)22■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 30.4
PABPN1Q86U42 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.715e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.325e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.245e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.245e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.165e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.865e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.815e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.745e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 MRPL52-213ENST00000556465 220 ntTSL 332.02■■■□□ 2.725e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 MRPL52-205ENST00000432849 411 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.015e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 MRPL52-204ENST00000397505 333 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 MRPL52-214ENST00000556654 362 ntTSL 314.52□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 MRPL52-209ENST00000553965 327 ntTSL 28.76□□□□□ -1.015e-7■■■■■ 30.3
PABPN1Q86U42 POLE-217ENST00000541627 2105 ntTSL 229.05■■■□□ 2.242e-7■■■■■ 30.2
PABPN1Q86U42 STXBP2-213ENST00000599278 295 ntTSL 331.04■■■□□ 2.565e-9■■■■■ 30.1
PABPN1Q86U42 CHRD-211ENST00000464833 1340 ntTSL 553.74■■■■■ 6.192e-9■■■■■ 30
PABPN1Q86U42 MRPL28-205ENST00000447696 722 ntTSL 348.72■■■■■ 5.394e-8■■■■■ 30
PABPN1Q86U42 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.244e-8■■■■■ 30
PABPN1Q86U42 CD99-208ENST00000482405 842 ntTSL 241.53■■■■■ 4.244e-8■■■■■ 30
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