Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ckap2lQ7TS74 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ckap2lQ7TS74 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ckap2lQ7TS74 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ckap2lQ7TS74 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ckap2lQ7TS74 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ckap2lQ7TS74 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ckap2lQ7TS74 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ckap2lQ7TS74 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ckap2lQ7TS74 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ckap2lQ7TS74 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ckap2lQ7TS74 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ckap2lQ7TS74 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ckap2lQ7TS74 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ckap2lQ7TS74 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ckap2lQ7TS74 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ckap2lQ7TS74 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ckap2lQ7TS74 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ckap2lQ7TS74 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ckap2lQ7TS74 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ckap2lQ7TS74 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ckap2lQ7TS74 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ckap2lQ7TS74 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ckap2lQ7TS74 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ckap2lQ7TS74 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ckap2lQ7TS74 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ckap2lQ7TS74 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ckap2lQ7TS74 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ckap2lQ7TS74 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ckap2lQ7TS74 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ckap2lQ7TS74 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ckap2lQ7TS74 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ckap2lQ7TS74 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ckap2lQ7TS74 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ckap2lQ7TS74 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ckap2lQ7TS74 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ckap2lQ7TS74 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ckap2lQ7TS74 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ckap2lQ7TS74 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ckap2lQ7TS74 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ckap2lQ7TS74 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ckap2lQ7TS74 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ckap2lQ7TS74 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ckap2lQ7TS74 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ckap2lQ7TS74 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ckap2lQ7TS74 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ckap2lQ7TS74 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ckap2lQ7TS74 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ckap2lQ7TS74 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ckap2lQ7TS74 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ckap2lQ7TS74 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ckap2lQ7TS74 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ckap2lQ7TS74 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ckap2lQ7TS74 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ckap2lQ7TS74 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ckap2lQ7TS74 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ckap2lQ7TS74 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ckap2lQ7TS74 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ckap2lQ7TS74 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ckap2lQ7TS74 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ckap2lQ7TS74 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ckap2lQ7TS74 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ckap2lQ7TS74 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ckap2lQ7TS74 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ckap2lQ7TS74 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ckap2lQ7TS74 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ckap2lQ7TS74 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ckap2lQ7TS74 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ckap2lQ7TS74 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ckap2lQ7TS74 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ckap2lQ7TS74 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ckap2lQ7TS74 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ckap2lQ7TS74 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ckap2lQ7TS74 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ckap2lQ7TS74 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ckap2lQ7TS74 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ckap2lQ7TS74 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ckap2lQ7TS74 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ckap2lQ7TS74 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ckap2lQ7TS74 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ckap2lQ7TS74 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ckap2lQ7TS74 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ckap2lQ7TS74 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ckap2lQ7TS74 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ckap2lQ7TS74 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ckap2lQ7TS74 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ckap2lQ7TS74 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ckap2lQ7TS74 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms