Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,54■■■■□ 3,28
Ckap2lQ7TS74 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Ckap2lQ7TS74 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Ckap2lQ7TS74 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Ckap2lQ7TS74 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Ckap2lQ7TS74 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Ckap2lQ7TS74 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,67■■■□□ 2,66
Ckap2lQ7TS74 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Ckap2lQ7TS74 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,53■■■□□ 2,64
Ckap2lQ7TS74 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Ckap2lQ7TS74 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,09■■■□□ 2,57
Ckap2lQ7TS74 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Ckap2lQ7TS74 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Ckap2lQ7TS74 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,7■■■□□ 2,51
Ckap2lQ7TS74 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Ckap2lQ7TS74 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Ckap2lQ7TS74 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Ckap2lQ7TS74 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Ckap2lQ7TS74 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ckap2lQ7TS74 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ckap2lQ7TS74 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ckap2lQ7TS74 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ckap2lQ7TS74 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ckap2lQ7TS74 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ckap2lQ7TS74 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ckap2lQ7TS74 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Ckap2lQ7TS74 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Ckap2lQ7TS74 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Ckap2lQ7TS74 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ckap2lQ7TS74 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ckap2lQ7TS74 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ckap2lQ7TS74 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ckap2lQ7TS74 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Ckap2lQ7TS74 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ckap2lQ7TS74 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ckap2lQ7TS74 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ckap2lQ7TS74 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ckap2lQ7TS74 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ckap2lQ7TS74 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Ckap2lQ7TS74 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Ckap2lQ7TS74 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Ckap2lQ7TS74 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2,23
Ckap2lQ7TS74 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Ckap2lQ7TS74 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Ckap2lQ7TS74 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Ckap2lQ7TS74 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ckap2lQ7TS74 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ckap2lQ7TS74 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Ckap2lQ7TS74 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Ckap2lQ7TS74 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ckap2lQ7TS74 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ckap2lQ7TS74 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ckap2lQ7TS74 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ckap2lQ7TS74 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ckap2lQ7TS74 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ckap2lQ7TS74 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ckap2lQ7TS74 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Ckap2lQ7TS74 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ckap2lQ7TS74 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ckap2lQ7TS74 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Ckap2lQ7TS74 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ckap2lQ7TS74 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ckap2lQ7TS74 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Ckap2lQ7TS74 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ckap2lQ7TS74 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ckap2lQ7TS74 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Ckap2lQ7TS74 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ckap2lQ7TS74 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ckap2lQ7TS74 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ckap2lQ7TS74 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ckap2lQ7TS74 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ckap2lQ7TS74 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ckap2lQ7TS74 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ckap2lQ7TS74 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Ckap2lQ7TS74 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Ckap2lQ7TS74 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ckap2lQ7TS74 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ckap2lQ7TS74 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ckap2lQ7TS74 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ckap2lQ7TS74 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ckap2lQ7TS74 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ckap2lQ7TS74 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ckap2lQ7TS74 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ckap2lQ7TS74 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ckap2lQ7TS74 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ckap2lQ7TS74 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ckap2lQ7TS74 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ckap2lQ7TS74 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Ckap2lQ7TS74 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ckap2lQ7TS74 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ckap2lQ7TS74 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ckap2lQ7TS74 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ckap2lQ7TS74 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ckap2lQ7TS74 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ckap2lQ7TS74 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ckap2lQ7TS74 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ckap2lQ7TS74 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ckap2lQ7TS74 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms