Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrn2Q6PHP6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrn2Q6PHP6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrrn2Q6PHP6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrrn2Q6PHP6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrn2Q6PHP6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrn2Q6PHP6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrn2Q6PHP6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrrn2Q6PHP6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrrn2Q6PHP6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrrn2Q6PHP6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrn2Q6PHP6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrn2Q6PHP6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrn2Q6PHP6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrn2Q6PHP6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrrn2Q6PHP6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrn2Q6PHP6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrn2Q6PHP6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrn2Q6PHP6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrn2Q6PHP6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrn2Q6PHP6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrn2Q6PHP6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrn2Q6PHP6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrn2Q6PHP6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrrn2Q6PHP6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrrn2Q6PHP6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrn2Q6PHP6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrn2Q6PHP6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrn2Q6PHP6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrn2Q6PHP6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrn2Q6PHP6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrn2Q6PHP6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrn2Q6PHP6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrrn2Q6PHP6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrn2Q6PHP6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrn2Q6PHP6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrn2Q6PHP6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrn2Q6PHP6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrn2Q6PHP6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrrn2Q6PHP6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrn2Q6PHP6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrn2Q6PHP6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrn2Q6PHP6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrn2Q6PHP6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Lrrn2Q6PHP6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrrn2Q6PHP6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrn2Q6PHP6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrn2Q6PHP6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrn2Q6PHP6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrn2Q6PHP6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrn2Q6PHP6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrn2Q6PHP6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrn2Q6PHP6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrn2Q6PHP6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrn2Q6PHP6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrn2Q6PHP6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrn2Q6PHP6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrn2Q6PHP6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrn2Q6PHP6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrn2Q6PHP6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrn2Q6PHP6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrn2Q6PHP6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrn2Q6PHP6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrn2Q6PHP6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrn2Q6PHP6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrn2Q6PHP6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrn2Q6PHP6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrn2Q6PHP6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrn2Q6PHP6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrn2Q6PHP6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrn2Q6PHP6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrn2Q6PHP6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrn2Q6PHP6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrn2Q6PHP6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrn2Q6PHP6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrn2Q6PHP6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrn2Q6PHP6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrrn2Q6PHP6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrrn2Q6PHP6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrrn2Q6PHP6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrrn2Q6PHP6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrrn2Q6PHP6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrrn2Q6PHP6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrrn2Q6PHP6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrn2Q6PHP6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrn2Q6PHP6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lrrn2Q6PHP6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrrn2Q6PHP6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrrn2Q6PHP6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrrn2Q6PHP6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrrn2Q6PHP6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrrn2Q6PHP6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrrn2Q6PHP6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrn2Q6PHP6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrn2Q6PHP6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrn2Q6PHP6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrn2Q6PHP6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrn2Q6PHP6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms