Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNS5

Havcr1, Hepatitis A virus cellular receptor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Havcr1Q5QNS5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Havcr1Q5QNS5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Havcr1Q5QNS5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Havcr1Q5QNS5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Havcr1Q5QNS5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Havcr1Q5QNS5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Havcr1Q5QNS5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Havcr1Q5QNS5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Havcr1Q5QNS5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Havcr1Q5QNS5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Havcr1Q5QNS5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Havcr1Q5QNS5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Havcr1Q5QNS5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Havcr1Q5QNS5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Havcr1Q5QNS5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Havcr1Q5QNS5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Havcr1Q5QNS5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Havcr1Q5QNS5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Havcr1Q5QNS5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Havcr1Q5QNS5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Havcr1Q5QNS5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Havcr1Q5QNS5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Havcr1Q5QNS5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Havcr1Q5QNS5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Havcr1Q5QNS5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Havcr1Q5QNS5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Havcr1Q5QNS5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Havcr1Q5QNS5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Havcr1Q5QNS5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Havcr1Q5QNS5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Havcr1Q5QNS5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Havcr1Q5QNS5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Havcr1Q5QNS5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Havcr1Q5QNS5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Havcr1Q5QNS5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Havcr1Q5QNS5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Havcr1Q5QNS5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Havcr1Q5QNS5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Havcr1Q5QNS5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Havcr1Q5QNS5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Havcr1Q5QNS5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Havcr1Q5QNS5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Havcr1Q5QNS5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Havcr1Q5QNS5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Havcr1Q5QNS5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Havcr1Q5QNS5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Havcr1Q5QNS5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Havcr1Q5QNS5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Havcr1Q5QNS5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Havcr1Q5QNS5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Havcr1Q5QNS5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Havcr1Q5QNS5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Havcr1Q5QNS5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Havcr1Q5QNS5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Havcr1Q5QNS5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Havcr1Q5QNS5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Havcr1Q5QNS5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Havcr1Q5QNS5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Havcr1Q5QNS5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Havcr1Q5QNS5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Havcr1Q5QNS5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Havcr1Q5QNS5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Havcr1Q5QNS5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Havcr1Q5QNS5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Havcr1Q5QNS5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Havcr1Q5QNS5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Havcr1Q5QNS5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Havcr1Q5QNS5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Havcr1Q5QNS5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Havcr1Q5QNS5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Havcr1Q5QNS5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Havcr1Q5QNS5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Havcr1Q5QNS5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Havcr1Q5QNS5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Havcr1Q5QNS5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Havcr1Q5QNS5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Havcr1Q5QNS5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Havcr1Q5QNS5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Havcr1Q5QNS5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Havcr1Q5QNS5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Havcr1Q5QNS5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Havcr1Q5QNS5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Havcr1Q5QNS5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Havcr1Q5QNS5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Havcr1Q5QNS5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Havcr1Q5QNS5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Havcr1Q5QNS5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Havcr1Q5QNS5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.3 ms