Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Pnma5Q5DTT8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pnma5Q5DTT8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pnma5Q5DTT8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pnma5Q5DTT8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pnma5Q5DTT8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pnma5Q5DTT8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pnma5Q5DTT8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pnma5Q5DTT8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Pnma5Q5DTT8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pnma5Q5DTT8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pnma5Q5DTT8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pnma5Q5DTT8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pnma5Q5DTT8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pnma5Q5DTT8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pnma5Q5DTT8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pnma5Q5DTT8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pnma5Q5DTT8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pnma5Q5DTT8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pnma5Q5DTT8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pnma5Q5DTT8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pnma5Q5DTT8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pnma5Q5DTT8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pnma5Q5DTT8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pnma5Q5DTT8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pnma5Q5DTT8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pnma5Q5DTT8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pnma5Q5DTT8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pnma5Q5DTT8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pnma5Q5DTT8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pnma5Q5DTT8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pnma5Q5DTT8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pnma5Q5DTT8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pnma5Q5DTT8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pnma5Q5DTT8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pnma5Q5DTT8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pnma5Q5DTT8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pnma5Q5DTT8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pnma5Q5DTT8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Pnma5Q5DTT8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pnma5Q5DTT8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pnma5Q5DTT8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Pnma5Q5DTT8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pnma5Q5DTT8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pnma5Q5DTT8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pnma5Q5DTT8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pnma5Q5DTT8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pnma5Q5DTT8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pnma5Q5DTT8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pnma5Q5DTT8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pnma5Q5DTT8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pnma5Q5DTT8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pnma5Q5DTT8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pnma5Q5DTT8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pnma5Q5DTT8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pnma5Q5DTT8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pnma5Q5DTT8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pnma5Q5DTT8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pnma5Q5DTT8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pnma5Q5DTT8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pnma5Q5DTT8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pnma5Q5DTT8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pnma5Q5DTT8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pnma5Q5DTT8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pnma5Q5DTT8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pnma5Q5DTT8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pnma5Q5DTT8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pnma5Q5DTT8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pnma5Q5DTT8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pnma5Q5DTT8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pnma5Q5DTT8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pnma5Q5DTT8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pnma5Q5DTT8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pnma5Q5DTT8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pnma5Q5DTT8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pnma5Q5DTT8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pnma5Q5DTT8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Pnma5Q5DTT8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pnma5Q5DTT8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pnma5Q5DTT8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pnma5Q5DTT8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Pnma5Q5DTT8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pnma5Q5DTT8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pnma5Q5DTT8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pnma5Q5DTT8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pnma5Q5DTT8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms