Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Trp53i11Q4QQM4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Trp53i11Q4QQM4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Trp53i11Q4QQM4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Trp53i11Q4QQM4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Trp53i11Q4QQM4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Trp53i11Q4QQM4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Trp53i11Q4QQM4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Trp53i11Q4QQM4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Trp53i11Q4QQM4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Trp53i11Q4QQM4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Trp53i11Q4QQM4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Trp53i11Q4QQM4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Trp53i11Q4QQM4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Trp53i11Q4QQM4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Trp53i11Q4QQM4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Trp53i11Q4QQM4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Trp53i11Q4QQM4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Trp53i11Q4QQM4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Trp53i11Q4QQM4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Trp53i11Q4QQM4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Trp53i11Q4QQM4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Trp53i11Q4QQM4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Trp53i11Q4QQM4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Trp53i11Q4QQM4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Trp53i11Q4QQM4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Trp53i11Q4QQM4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,64■■□□□ 1,53
Trp53i11Q4QQM4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Trp53i11Q4QQM4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Trp53i11Q4QQM4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Trp53i11Q4QQM4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Trp53i11Q4QQM4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Trp53i11Q4QQM4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Trp53i11Q4QQM4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Trp53i11Q4QQM4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Trp53i11Q4QQM4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Trp53i11Q4QQM4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Trp53i11Q4QQM4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Trp53i11Q4QQM4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Trp53i11Q4QQM4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Trp53i11Q4QQM4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Trp53i11Q4QQM4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Trp53i11Q4QQM4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Trp53i11Q4QQM4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Trp53i11Q4QQM4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Trp53i11Q4QQM4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Trp53i11Q4QQM4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Trp53i11Q4QQM4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Trp53i11Q4QQM4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Trp53i11Q4QQM4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Trp53i11Q4QQM4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Trp53i11Q4QQM4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Trp53i11Q4QQM4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Trp53i11Q4QQM4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Trp53i11Q4QQM4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Trp53i11Q4QQM4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Trp53i11Q4QQM4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Trp53i11Q4QQM4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Trp53i11Q4QQM4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Trp53i11Q4QQM4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Trp53i11Q4QQM4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Trp53i11Q4QQM4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Trp53i11Q4QQM4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Trp53i11Q4QQM4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Trp53i11Q4QQM4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Trp53i11Q4QQM4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Trp53i11Q4QQM4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Trp53i11Q4QQM4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
Trp53i11Q4QQM4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Trp53i11Q4QQM4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Trp53i11Q4QQM4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Trp53i11Q4QQM4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Trp53i11Q4QQM4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Trp53i11Q4QQM4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Trp53i11Q4QQM4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Trp53i11Q4QQM4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Trp53i11Q4QQM4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Trp53i11Q4QQM4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Trp53i11Q4QQM4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Trp53i11Q4QQM4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Trp53i11Q4QQM4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Trp53i11Q4QQM4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24,13■■□□□ 1,45
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