Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pydc3Q3V3Q4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pydc3Q3V3Q4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pydc3Q3V3Q4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pydc3Q3V3Q4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pydc3Q3V3Q4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pydc3Q3V3Q4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pydc3Q3V3Q4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pydc3Q3V3Q4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pydc3Q3V3Q4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pydc3Q3V3Q4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pydc3Q3V3Q4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pydc3Q3V3Q4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pydc3Q3V3Q4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pydc3Q3V3Q4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pydc3Q3V3Q4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pydc3Q3V3Q4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pydc3Q3V3Q4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pydc3Q3V3Q4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pydc3Q3V3Q4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pydc3Q3V3Q4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pydc3Q3V3Q4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pydc3Q3V3Q4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pydc3Q3V3Q4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pydc3Q3V3Q4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pydc3Q3V3Q4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pydc3Q3V3Q4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pydc3Q3V3Q4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pydc3Q3V3Q4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pydc3Q3V3Q4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pydc3Q3V3Q4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pydc3Q3V3Q4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pydc3Q3V3Q4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pydc3Q3V3Q4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pydc3Q3V3Q4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pydc3Q3V3Q4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pydc3Q3V3Q4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pydc3Q3V3Q4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pydc3Q3V3Q4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pydc3Q3V3Q4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pydc3Q3V3Q4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pydc3Q3V3Q4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pydc3Q3V3Q4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pydc3Q3V3Q4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pydc3Q3V3Q4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pydc3Q3V3Q4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pydc3Q3V3Q4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pydc3Q3V3Q4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pydc3Q3V3Q4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pydc3Q3V3Q4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pydc3Q3V3Q4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pydc3Q3V3Q4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pydc3Q3V3Q4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pydc3Q3V3Q4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pydc3Q3V3Q4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pydc3Q3V3Q4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pydc3Q3V3Q4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pydc3Q3V3Q4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pydc3Q3V3Q4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pydc3Q3V3Q4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pydc3Q3V3Q4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pydc3Q3V3Q4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pydc3Q3V3Q4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pydc3Q3V3Q4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pydc3Q3V3Q4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pydc3Q3V3Q4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pydc3Q3V3Q4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pydc3Q3V3Q4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pydc3Q3V3Q4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pydc3Q3V3Q4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pydc3Q3V3Q4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pydc3Q3V3Q4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pydc3Q3V3Q4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pydc3Q3V3Q4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pydc3Q3V3Q4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pydc3Q3V3Q4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pydc3Q3V3Q4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pydc3Q3V3Q4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pydc3Q3V3Q4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pydc3Q3V3Q4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pydc3Q3V3Q4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pydc3Q3V3Q4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pydc3Q3V3Q4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pydc3Q3V3Q4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pydc3Q3V3Q4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pydc3Q3V3Q4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms