Protein–RNA interactions for Protein: Q3E827

LSO1, Protein LSO1, yeastyeast

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSO1Q3E827 SNF6YHL025W 999 nt10.32□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 FMT1YBL013W 1206 nt10.3□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 SSN3YPL042C 1668 nt10.29□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 ABZ2YMR289W 1125 nt10.29□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 NPP1YCR026C 2229 nt10.28□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 SOR2YDL246C 1074 nt10.28□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 SOR1YJR159W 1074 nt10.28□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 CWP1YKL096W 720 nt10.28□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 YCL042WYCL042W 360 nt10.28□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 FMP45YDL222C 930 nt10.27□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 YJL118WYJL118W 660 nt10.27□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 ERV46YAL042W 1248 nt10.26□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 ADH2YMR303C 1047 nt10.26□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 PBP1YGR178C 2169 nt10.25□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 CYT2YKL087C 675 nt10.25□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 YKR040CYKR040C 504 nt10.24□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 BIO4YNR057C 714 nt10.24□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 COG1YGL223C 1254 nt10.23□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 GID7YCL039W 2238 nt10.23□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 LYS4YDR234W 2082 nt10.22□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.21□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 ERF2YLR246W 1080 nt10.21□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 AAC1YMR056C 930 nt10.21□□□□□ -0.77
LSO1Q3E827 MXR2YCL033C 507 nt10.2□□□□□ -0.78
LSO1Q3E827 SWE1YJL187C 2460 nt10.19□□□□□ -0.78
LSO1Q3E827 YPR011CYPR011C 981 nt10.19□□□□□ -0.78
LSO1Q3E827 YIH1YCR059C 777 nt10.18□□□□□ -0.78
LSO1Q3E827 YPL041CYPL041C 624 nt10.18□□□□□ -0.78
LSO1Q3E827 RNQ1YCL028W 1218 nt10.16□□□□□ -0.78
LSO1Q3E827 BIO5YNR056C 1686 nt10.15□□□□□ -0.78
LSO1Q3E827 CRR1YLR213C 1269 nt10.13□□□□□ -0.79
LSO1Q3E827 LPX1YOR084W 1164 nt10.13□□□□□ -0.79
LSO1Q3E827 FRD1YEL047C 1413 nt10.12□□□□□ -0.79
LSO1Q3E827 FTH1YBR207W 1398 nt10.11□□□□□ -0.79
LSO1Q3E827 BUR6YER159C 429 nt10.09□□□□□ -0.79
LSO1Q3E827 YLL053CYLL053C 459 nt10.09□□□□□ -0.79
LSO1Q3E827 YFL067WYFL067W 528 nt10.08□□□□□ -0.8
LSO1Q3E827 RSC4YKR008W 1878 nt10.07□□□□□ -0.8
LSO1Q3E827 PRP4YPR178W 1398 nt10.06□□□□□ -0.8
LSO1Q3E827 MAE1YKL029C 2010 nt10.06□□□□□ -0.8
LSO1Q3E827 HEM12YDR047W 1089 nt10.05□□□□□ -0.8
LSO1Q3E827 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt10.04□□□□□ -0.8
LSO1Q3E827 FTR1YER145C 1215 nt10.03□□□□□ -0.8
LSO1Q3E827 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.03□□□□□ -0.8
LSO1Q3E827 HMG2YLR450W 3138 nt10.02□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 YTH1YPR107C 627 nt10.02□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 FUR4YBR021W 1902 nt10.01□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 DIC1YLR348C 897 nt10.01□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 DPS1YLL018C 1674 nt10.01□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 RIM8YGL045W 1629 nt10□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 AQY1YPR192W 918 nt10□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 TPO4YOR273C 1980 nt10□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 ATF2YGR177C 1608 nt10□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 RAX1YOR301W 1308 nt9.99□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 NDI1YML120C 1542 nt9.98□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.98□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 YEL076CYEL076C 651 nt9.98□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 YLR464WYLR464W 651 nt9.98□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 DDR2YOL052C-A 186 nt9.98□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 SNG1YGR197C 1644 nt9.97□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 YHM2YMR241W 945 nt9.97□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 GAL1YBR020W 1587 nt9.97□□□□□ -0.81
LSO1Q3E827 TRM5YHR070W 1500 nt9.94□□□□□ -0.82
LSO1Q3E827 UGA4YDL210W 1716 nt9.93□□□□□ -0.82
LSO1Q3E827 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.93□□□□□ -0.82
LSO1Q3E827 NAS6YGR232W 687 nt9.93□□□□□ -0.82
LSO1Q3E827 YLR235CYLR235C 399 nt9.93□□□□□ -0.82
LSO1Q3E827 MIC10YCL057C-A 294 nt9.93□□□□□ -0.82
LSO1Q3E827 SNF1YDR477W 1902 nt9.92□□□□□ -0.82
LSO1Q3E827 ESBP6YNL125C 2022 nt9.92□□□□□ -0.82
LSO1Q3E827 XDJ1YLR090W 1380 nt9.91□□□□□ -0.82
LSO1Q3E827 FAF1YIL019W 1041 nt9.91□□□□□ -0.82
LSO1Q3E827 SRN2YLR119W 642 nt9.91□□□□□ -0.82
LSO1Q3E827 URA8YJR103W 1737 nt9.89□□□□□ -0.83
LSO1Q3E827 ANP1YEL036C 1503 nt9.88□□□□□ -0.83
LSO1Q3E827 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt9.88□□□□□ -0.83
LSO1Q3E827 BNA2YJR078W 1362 nt9.88□□□□□ -0.83
LSO1Q3E827 HMT1YBR034C 1047 nt9.87□□□□□ -0.83
LSO1Q3E827 YGL114WYGL114W 2178 nt9.86□□□□□ -0.83
LSO1Q3E827 PUS5YLR165C 765 nt9.85□□□□□ -0.83
LSO1Q3E827 TIM23YNR017W 669 nt9.85□□□□□ -0.83
LSO1Q3E827 CCA1YER168C 1641 nt9.85□□□□□ -0.83
LSO1Q3E827 SPC25YER018C 666 nt9.84□□□□□ -0.83
LSO1Q3E827 BNS1YGR230W 414 nt9.84□□□□□ -0.83
LSO1Q3E827 STB1YNL309W 1263 nt9.84□□□□□ -0.83
LSO1Q3E827 GPI16YHR188C 1833 nt9.83□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 ILV2YMR108W 2064 nt9.83□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 BMT5YIL096C 1011 nt9.82□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 YLR179CYLR179C 606 nt9.82□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 REC114YMR133W 1287 nt9.82□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.81□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 PTH1YHR189W 573 nt9.81□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 SPT20YOL148C 1815 nt9.81□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 FHN1YGR131W 525 nt9.8□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 BMT6YLR063W 1098 nt9.8□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 ACO2YJL200C 2370 nt9.8□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 FEN2YCR028C 1539 nt9.79□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 MIC12YBR262C 321 nt9.79□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 GTB1YDR221W 2109 nt9.79□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 BSP1YPR171W 1731 nt9.78□□□□□ -0.84
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