Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 NCP1YHR042W 2076 nt11.57□□□□□ -0.56
CTF3Q12748 YFL066CYFL066C 1179 nt11.57□□□□□ -0.56
CTF3Q12748 GUT2YIL155C 1950 nt11.56□□□□□ -0.56
CTF3Q12748 SPC25YER018C 666 nt11.56□□□□□ -0.56
CTF3Q12748 ERF2YLR246W 1080 nt11.56□□□□□ -0.56
CTF3Q12748 DDR2YOL052C-A 186 nt11.56□□□□□ -0.56
CTF3Q12748 BDH1YAL060W 1149 nt11.55□□□□□ -0.56
CTF3Q12748 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.54□□□□□ -0.56
CTF3Q12748 YFL067WYFL067W 528 nt11.54□□□□□ -0.56
CTF3Q12748 CCT4YDL143W 1587 nt11.54□□□□□ -0.56
CTF3Q12748 PEX25YPL112C 1185 nt11.52□□□□□ -0.57
CTF3Q12748 CRR1YLR213C 1269 nt11.51□□□□□ -0.57
CTF3Q12748 YSP3YOR003W 1437 nt11.51□□□□□ -0.57
CTF3Q12748 YLR415CYLR415C 339 nt11.5□□□□□ -0.57
CTF3Q12748 GPI16YHR188C 1833 nt11.5□□□□□ -0.57
CTF3Q12748 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.49□□□□□ -0.57
CTF3Q12748 VPS60YDR486C 690 nt11.48□□□□□ -0.57
CTF3Q12748 YNL115CYNL115C 1935 nt11.48□□□□□ -0.57
CTF3Q12748 LYS4YDR234W 2082 nt11.47□□□□□ -0.57
CTF3Q12748 SWC5YBR231C 912 nt11.46□□□□□ -0.57
CTF3Q12748 BOP3YNL042W 1191 nt11.45□□□□□ -0.58
CTF3Q12748 FEN2YCR028C 1539 nt11.44□□□□□ -0.58
CTF3Q12748 RTF1YGL244W 1677 nt11.43□□□□□ -0.58
CTF3Q12748 SNG1YGR197C 1644 nt11.43□□□□□ -0.58
CTF3Q12748 ANP1YEL036C 1503 nt11.43□□□□□ -0.58
CTF3Q12748 PIB2YGL023C 1908 nt11.43□□□□□ -0.58
CTF3Q12748 ALG3YBL082C 1377 nt11.42□□□□□ -0.58
CTF3Q12748 HEM12YDR047W 1089 nt11.41□□□□□ -0.58
CTF3Q12748 MIC10YCL057C-A 294 nt11.41□□□□□ -0.58
CTF3Q12748 SBA1YKL117W 651 nt11.37□□□□□ -0.59
CTF3Q12748 YIR016WYIR016W 798 nt11.33□□□□□ -0.6
CTF3Q12748 NAT4YMR069W 858 nt11.33□□□□□ -0.6
CTF3Q12748 SPT8YLR055C 1809 nt11.32□□□□□ -0.6
CTF3Q12748 GLK1YCL040W 1503 nt11.3□□□□□ -0.6
CTF3Q12748 VPS75YNL246W 795 nt11.29□□□□□ -0.6
CTF3Q12748 PTK1YKL198C 1989 nt11.28□□□□□ -0.6
CTF3Q12748 MIR1YJR077C 936 nt11.25□□□□□ -0.61
CTF3Q12748 MSF1YPR047W 1410 nt11.23□□□□□ -0.61
CTF3Q12748 THI74YDR438W 1113 nt11.22□□□□□ -0.61
CTF3Q12748 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.2□□□□□ -0.62
CTF3Q12748 TIM17YJL143W 477 nt11.2□□□□□ -0.62
CTF3Q12748 BNA2YJR078W 1362 nt11.18□□□□□ -0.62
CTF3Q12748 SHM2YLR058C 1410 nt11.17□□□□□ -0.62
CTF3Q12748 PAU7YAR020C 168 nt11.16□□□□□ -0.62
CTF3Q12748 PAC11YDR488C 1602 nt11.16□□□□□ -0.62
CTF3Q12748 XDJ1YLR090W 1380 nt11.16□□□□□ -0.62
CTF3Q12748 MIC12YBR262C 321 nt11.14□□□□□ -0.63
CTF3Q12748 RAX1YOR301W 1308 nt11.13□□□□□ -0.63
CTF3Q12748 YFL054CYFL054C 1941 nt11.12□□□□□ -0.63
CTF3Q12748 DAT1YML113W 747 nt11.11□□□□□ -0.63
CTF3Q12748 GDH3YAL062W 1374 nt11.08□□□□□ -0.64
CTF3Q12748 HHO1YPL127C 777 nt11.07□□□□□ -0.64
CTF3Q12748 NIT1YIL164C 600 nt11.06□□□□□ -0.64
CTF3Q12748 SHB17YKR043C 816 nt11.06□□□□□ -0.64
CTF3Q12748 SGT2YOR007C 1041 nt11.06□□□□□ -0.64
CTF3Q12748 UBA4YHR111W 1323 nt11.06□□□□□ -0.64
CTF3Q12748 YGL034CYGL034C 366 nt11.02□□□□□ -0.65
CTF3Q12748 YGR201CYGR201C 678 nt11.02□□□□□ -0.65
CTF3Q12748 YDR010CYDR010C 333 nt10.99□□□□□ -0.65
CTF3Q12748 YSR3YKR053C 1215 nt10.99□□□□□ -0.65
CTF3Q12748 AVT6YER119C 1347 nt10.97□□□□□ -0.65
CTF3Q12748 XYL2YLR070C 1071 nt10.95□□□□□ -0.66
CTF3Q12748 YMR244WYMR244W 1068 nt10.93□□□□□ -0.66
CTF3Q12748 CCA1YER168C 1641 nt10.91□□□□□ -0.66
CTF3Q12748 GOR1YNL274C 1053 nt10.91□□□□□ -0.66
CTF3Q12748 AGP1YCL025C 1902 nt10.91□□□□□ -0.66
CTF3Q12748 RET2YFR051C 1641 nt10.91□□□□□ -0.66
CTF3Q12748 PHO89YBR296C 1725 nt10.9□□□□□ -0.66
CTF3Q12748 GLR1YPL091W 1452 nt10.9□□□□□ -0.66
CTF3Q12748 RBG1YAL036C 1110 nt10.89□□□□□ -0.67
CTF3Q12748 DUT1YBR252W 444 nt10.89□□□□□ -0.67
CTF3Q12748 NDI1YML120C 1542 nt10.89□□□□□ -0.67
CTF3Q12748 SWE1YJL187C 2460 nt10.87□□□□□ -0.67
CTF3Q12748 YCR087WYCR087W 516 nt10.83□□□□□ -0.68
CTF3Q12748 YCR102CYCR102C 1107 nt10.82□□□□□ -0.68
CTF3Q12748 AIM45YPR004C 1035 nt10.8□□□□□ -0.68
CTF3Q12748 NVJ2YPR091C 2313 nt10.8□□□□□ -0.68
CTF3Q12748 SFA1YDL168W 1161 nt10.77□□□□□ -0.69
CTF3Q12748 MRP20YDR405W 792 nt10.77□□□□□ -0.69
CTF3Q12748 COQ2YNR041C 1119 nt10.77□□□□□ -0.69
CTF3Q12748 DUS1YML080W 1272 nt10.73□□□□□ -0.69
CTF3Q12748 RBG2YGR173W 1107 nt10.72□□□□□ -0.69
CTF3Q12748 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.72□□□□□ -0.69
CTF3Q12748 NBP35YGL091C 987 nt10.69□□□□□ -0.7
CTF3Q12748 SHH4YLR164W 507 nt10.68□□□□□ -0.7
CTF3Q12748 STR3YGL184C 1398 nt10.65□□□□□ -0.7
CTF3Q12748 AQY2YLL052C 450 nt10.65□□□□□ -0.7
CTF3Q12748 TIR3YIL011W 810 nt10.64□□□□□ -0.71
CTF3Q12748 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.63□□□□□ -0.71
CTF3Q12748 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.63□□□□□ -0.71
CTF3Q12748 YMR226CYMR226C 804 nt10.62□□□□□ -0.71
CTF3Q12748 RPL4BYDR012W 1089 nt10.61□□□□□ -0.71
CTF3Q12748 RPL4AYBR031W 1089 nt10.61□□□□□ -0.71
CTF3Q12748 YCL074WYCL074W 927 nt10.6□□□□□ -0.71
CTF3Q12748 TOM6YOR045W 186 nt10.6□□□□□ -0.71
CTF3Q12748 CLB6YGR109C 1143 nt10.58□□□□□ -0.72
CTF3Q12748 RPS14BYJL191W 417 nt10.56□□□□□ -0.72
CTF3Q12748 POM34YLR018C 900 nt10.56□□□□□ -0.72
CTF3Q12748 YJL225CYJL225C 5277 nt10.55□□□□□ -0.72
CTF3Q12748 PEX2YJL210W 816 nt10.55□□□□□ -0.72
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