Protein–RNA interactions for Protein: Q12734

CSR2, Transcription factor CSR2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSR2Q12734 YNL195CYNL195C 786 nt12.54□□□□□ -0.4
CSR2Q12734 BIO4YNR057C 714 nt12.53□□□□□ -0.4
CSR2Q12734 TRM5YHR070W 1500 nt12.51□□□□□ -0.41
CSR2Q12734 CCT4YDL143W 1587 nt12.49□□□□□ -0.41
CSR2Q12734 STB1YNL309W 1263 nt12.49□□□□□ -0.41
CSR2Q12734 YBR220CYBR220C 1683 nt12.48□□□□□ -0.41
CSR2Q12734 SIM1YIL123W 1431 nt12.47□□□□□ -0.41
CSR2Q12734 VPS75YNL246W 795 nt12.46□□□□□ -0.41
CSR2Q12734 SPC25YER018C 666 nt12.45□□□□□ -0.42
CSR2Q12734 DAT1YML113W 747 nt12.45□□□□□ -0.42
CSR2Q12734 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.44□□□□□ -0.42
CSR2Q12734 RRT12YCR045C 1476 nt12.43□□□□□ -0.42
CSR2Q12734 SWC5YBR231C 912 nt12.43□□□□□ -0.42
CSR2Q12734 GPI16YHR188C 1833 nt12.41□□□□□ -0.42
CSR2Q12734 VPS60YDR486C 690 nt12.39□□□□□ -0.43
CSR2Q12734 YGL034CYGL034C 366 nt12.39□□□□□ -0.43
CSR2Q12734 DDR2YOL052C-A 186 nt12.38□□□□□ -0.43
CSR2Q12734 PAU7YAR020C 168 nt12.36□□□□□ -0.43
CSR2Q12734 ATF2YGR177C 1608 nt12.35□□□□□ -0.43
CSR2Q12734 ALG3YBL082C 1377 nt12.33□□□□□ -0.44
CSR2Q12734 NDI1YML120C 1542 nt12.33□□□□□ -0.44
CSR2Q12734 SPT8YLR055C 1809 nt12.32□□□□□ -0.44
CSR2Q12734 YFL067WYFL067W 528 nt12.3□□□□□ -0.44
CSR2Q12734 UBA4YHR111W 1323 nt12.29□□□□□ -0.44
CSR2Q12734 SSA4YER103W 1929 nt12.29□□□□□ -0.44
CSR2Q12734 FEN2YCR028C 1539 nt12.27□□□□□ -0.44
CSR2Q12734 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.27□□□□□ -0.45
CSR2Q12734 ERF2YLR246W 1080 nt12.26□□□□□ -0.45
CSR2Q12734 SAM1YLR180W 1149 nt12.25□□□□□ -0.45
CSR2Q12734 YHL050CYHL050C 2094 nt12.23□□□□□ -0.45
CSR2Q12734 RBG1YAL036C 1110 nt12.23□□□□□ -0.45
CSR2Q12734 SHB17YKR043C 816 nt12.23□□□□□ -0.45
CSR2Q12734 YSR3YKR053C 1215 nt12.23□□□□□ -0.45
CSR2Q12734 RPM1RPM1 483 nt12.23□□□□□ -0.45
CSR2Q12734 YMR226CYMR226C 804 nt12.21□□□□□ -0.45
CSR2Q12734 ANP1YEL036C 1503 nt12.21□□□□□ -0.46
CSR2Q12734 XYL2YLR070C 1071 nt12.2□□□□□ -0.46
CSR2Q12734 CRR1YLR213C 1269 nt12.19□□□□□ -0.46
CSR2Q12734 TIM17YJL143W 477 nt12.18□□□□□ -0.46
CSR2Q12734 RAD51YER095W 1203 nt12.17□□□□□ -0.46
CSR2Q12734 YIR016WYIR016W 798 nt12.14□□□□□ -0.47
CSR2Q12734 SNG1YGR197C 1644 nt12.12□□□□□ -0.47
CSR2Q12734 YDR010CYDR010C 333 nt12.09□□□□□ -0.47
CSR2Q12734 HEM12YDR047W 1089 nt12.08□□□□□ -0.48
CSR2Q12734 SHM2YLR058C 1410 nt12.08□□□□□ -0.48
CSR2Q12734 MIC10YCL057C-A 294 nt12.07□□□□□ -0.48
CSR2Q12734 PHO89YBR296C 1725 nt12.04□□□□□ -0.48
CSR2Q12734 YCR087WYCR087W 516 nt12.04□□□□□ -0.48
CSR2Q12734 AIM45YPR004C 1035 nt12.03□□□□□ -0.48
CSR2Q12734 SGT2YOR007C 1041 nt12.01□□□□□ -0.49
CSR2Q12734 RET2YFR051C 1641 nt12□□□□□ -0.49
CSR2Q12734 YNR029CYNR029C 1290 nt11.99□□□□□ -0.49
CSR2Q12734 XDJ1YLR090W 1380 nt11.99□□□□□ -0.49
CSR2Q12734 NIT1YIL164C 600 nt11.96□□□□□ -0.49
CSR2Q12734 YLR111WYLR111W 333 nt11.94□□□□□ -0.5
CSR2Q12734 LYS4YDR234W 2082 nt11.94□□□□□ -0.5
CSR2Q12734 SEC11YIR022W 504 nt11.93□□□□□ -0.5
CSR2Q12734 STE4YOR212W 1272 nt11.91□□□□□ -0.5
CSR2Q12734 GDH3YAL062W 1374 nt11.9□□□□□ -0.5
CSR2Q12734 MRP20YDR405W 792 nt11.89□□□□□ -0.51
CSR2Q12734 YLR349WYLR349W 507 nt11.89□□□□□ -0.51
CSR2Q12734 NCP1YHR042W 2076 nt11.89□□□□□ -0.51
CSR2Q12734 BNA2YJR078W 1362 nt11.86□□□□□ -0.51
CSR2Q12734 COQ2YNR041C 1119 nt11.85□□□□□ -0.51
CSR2Q12734 ADH7YCR105W 1086 nt11.81□□□□□ -0.52
CSR2Q12734 MIC12YBR262C 321 nt11.79□□□□□ -0.52
CSR2Q12734 PAU15YIR041W 375 nt11.78□□□□□ -0.52
CSR2Q12734 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.75□□□□□ -0.53
CSR2Q12734 PCH2YBR186W 1695 nt11.75□□□□□ -0.53
CSR2Q12734 SDH5YOL071W 489 nt11.74□□□□□ -0.53
CSR2Q12734 SFA1YDL168W 1161 nt11.73□□□□□ -0.53
CSR2Q12734 HHO1YPL127C 777 nt11.73□□□□□ -0.53
CSR2Q12734 YGR201CYGR201C 678 nt11.72□□□□□ -0.53
CSR2Q12734 FUN14YAL008W 597 nt11.72□□□□□ -0.53
CSR2Q12734 AVT6YER119C 1347 nt11.71□□□□□ -0.53
CSR2Q12734 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.71□□□□□ -0.53
CSR2Q12734 RPL4BYDR012W 1089 nt11.69□□□□□ -0.54
CSR2Q12734 RAD23YEL037C 1197 nt11.69□□□□□ -0.54
CSR2Q12734 RPL4AYBR031W 1089 nt11.69□□□□□ -0.54
CSR2Q12734 BDF1YLR399C 2061 nt11.69□□□□□ -0.54
CSR2Q12734 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.68□□□□□ -0.54
CSR2Q12734 YLR279WYLR279W 390 nt11.68□□□□□ -0.54
CSR2Q12734 BOP3YNL042W 1191 nt11.68□□□□□ -0.54
CSR2Q12734 RAX1YOR301W 1308 nt11.67□□□□□ -0.54
CSR2Q12734 GUT2YIL155C 1950 nt11.65□□□□□ -0.55
CSR2Q12734 RPS14BYJL191W 417 nt11.63□□□□□ -0.55
CSR2Q12734 YJL195CYJL195C 702 nt11.63□□□□□ -0.55
CSR2Q12734 YCR102CYCR102C 1107 nt11.62□□□□□ -0.55
CSR2Q12734 CLB6YGR109C 1143 nt11.62□□□□□ -0.55
CSR2Q12734 GOR1YNL274C 1053 nt11.62□□□□□ -0.55
CSR2Q12734 RTF1YGL244W 1677 nt11.61□□□□□ -0.55
CSR2Q12734 CAB5YDR196C 726 nt11.6□□□□□ -0.55
CSR2Q12734 ESS1YJR017C 513 nt11.56□□□□□ -0.56
CSR2Q12734 TAT1YBR069C 1860 nt11.56□□□□□ -0.56
CSR2Q12734 RIB3YDR487C 627 nt11.55□□□□□ -0.56
CSR2Q12734 UTH1YKR042W 1098 nt11.54□□□□□ -0.56
CSR2Q12734 GPN2YOR262W 1044 nt11.54□□□□□ -0.56
CSR2Q12734 YGR012WYGR012W 1182 nt11.53□□□□□ -0.56
CSR2Q12734 DUT1YBR252W 444 nt11.53□□□□□ -0.56
CSR2Q12734 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms