Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

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Length 764 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 AQY1YPR192W 918 nt11.22□□□□□ -0.61
AVL9Q12500 STB1YNL309W 1263 nt11.21□□□□□ -0.61
AVL9Q12500 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.2□□□□□ -0.62
AVL9Q12500 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.19□□□□□ -0.62
AVL9Q12500 WSC2YNL283C 1512 nt11.19□□□□□ -0.62
AVL9Q12500 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.18□□□□□ -0.62
AVL9Q12500 YEL076CYEL076C 651 nt11.18□□□□□ -0.62
AVL9Q12500 YLR464WYLR464W 651 nt11.18□□□□□ -0.62
AVL9Q12500 YPR064WYPR064W 420 nt11.18□□□□□ -0.62
AVL9Q12500 AHT1YHR093W 549 nt11.16□□□□□ -0.62
AVL9Q12500 SWE1YJL187C 2460 nt11.15□□□□□ -0.62
AVL9Q12500 SPC25YER018C 666 nt11.15□□□□□ -0.62
AVL9Q12500 ANP1YEL036C 1503 nt11.14□□□□□ -0.63
AVL9Q12500 FEN2YCR028C 1539 nt11.13□□□□□ -0.63
AVL9Q12500 RAX1YOR301W 1308 nt11.12□□□□□ -0.63
AVL9Q12500 GPI16YHR188C 1833 nt11.12□□□□□ -0.63
AVL9Q12500 HUA1YGR268C 597 nt11.11□□□□□ -0.63
AVL9Q12500 CCT4YDL143W 1587 nt11.11□□□□□ -0.63
AVL9Q12500 VPS60YDR486C 690 nt11.1□□□□□ -0.63
AVL9Q12500 TAD3YLR316C 969 nt11.09□□□□□ -0.63
AVL9Q12500 MRPL8YJL063C 717 nt11.08□□□□□ -0.64
AVL9Q12500 BNA2YJR078W 1362 nt11.07□□□□□ -0.64
AVL9Q12500 SWC5YBR231C 912 nt11.07□□□□□ -0.64
AVL9Q12500 ADO1YJR105W 1023 nt11.05□□□□□ -0.64
AVL9Q12500 ALG3YBL082C 1377 nt11.04□□□□□ -0.64
AVL9Q12500 YIR016WYIR016W 798 nt11.04□□□□□ -0.64
AVL9Q12500 CCA1YER168C 1641 nt11.02□□□□□ -0.65
AVL9Q12500 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.99□□□□□ -0.65
AVL9Q12500 MIC12YBR262C 321 nt10.96□□□□□ -0.65
AVL9Q12500 HHO1YPL127C 777 nt10.95□□□□□ -0.66
AVL9Q12500 BDH1YAL060W 1149 nt10.94□□□□□ -0.66
AVL9Q12500 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.93□□□□□ -0.66
AVL9Q12500 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.93□□□□□ -0.66
AVL9Q12500 YLR415CYLR415C 339 nt10.92□□□□□ -0.66
AVL9Q12500 AGP1YCL025C 1902 nt10.88□□□□□ -0.67
AVL9Q12500 YSP3YOR003W 1437 nt10.84□□□□□ -0.67
AVL9Q12500 XDJ1YLR090W 1380 nt10.84□□□□□ -0.67
AVL9Q12500 DUS1YML080W 1272 nt10.83□□□□□ -0.68
AVL9Q12500 FUR4YBR021W 1902 nt10.82□□□□□ -0.68
AVL9Q12500 BOR1YNL275W 1731 nt10.81□□□□□ -0.68
AVL9Q12500 GDH3YAL062W 1374 nt10.8□□□□□ -0.68
AVL9Q12500 DUT1YBR252W 444 nt10.8□□□□□ -0.68
AVL9Q12500 YFL066CYFL066C 1179 nt10.79□□□□□ -0.68
AVL9Q12500 YGR201CYGR201C 678 nt10.79□□□□□ -0.68
AVL9Q12500 YNL115CYNL115C 1935 nt10.79□□□□□ -0.68
AVL9Q12500 HSP60YLR259C 1719 nt10.78□□□□□ -0.68
AVL9Q12500 AVT6YER119C 1347 nt10.77□□□□□ -0.69
AVL9Q12500 SHM2YLR058C 1410 nt10.76□□□□□ -0.69
AVL9Q12500 UME6YDR207C 2511 nt10.76□□□□□ -0.69
AVL9Q12500 GLK1YCL040W 1503 nt10.75□□□□□ -0.69
AVL9Q12500 TIM17YJL143W 477 nt10.74□□□□□ -0.69
AVL9Q12500 GOR1YNL274C 1053 nt10.74□□□□□ -0.69
AVL9Q12500 PEX25YPL112C 1185 nt10.74□□□□□ -0.69
AVL9Q12500 PRE6YOL038W 765 nt10.71□□□□□ -0.69
AVL9Q12500 YCL074WYCL074W 927 nt10.69□□□□□ -0.7
AVL9Q12500 YFR018CYFR018C 1092 nt10.69□□□□□ -0.7
AVL9Q12500 YDR094WYDR094W 336 nt10.67□□□□□ -0.7
AVL9Q12500 NIT1YIL164C 600 nt10.65□□□□□ -0.7
AVL9Q12500 UBX6YJL048C 1191 nt10.65□□□□□ -0.7
AVL9Q12500 AQY2YLL052C 450 nt10.65□□□□□ -0.7
AVL9Q12500 STR3YGL184C 1398 nt10.65□□□□□ -0.71
AVL9Q12500 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.64□□□□□ -0.71
AVL9Q12500 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.64□□□□□ -0.71
AVL9Q12500 SGT2YOR007C 1041 nt10.63□□□□□ -0.71
AVL9Q12500 PRP4YPR178W 1398 nt10.63□□□□□ -0.71
AVL9Q12500 VPS75YNL246W 795 nt10.6□□□□□ -0.71
AVL9Q12500 YKR005CYKR005C 1578 nt10.58□□□□□ -0.72
AVL9Q12500 RRT5YFR032C 870 nt10.57□□□□□ -0.72
AVL9Q12500 DPS1YLL018C 1674 nt10.55□□□□□ -0.72
AVL9Q12500 PAU16YKL224C 372 nt10.54□□□□□ -0.72
AVL9Q12500 PAU7YAR020C 168 nt10.54□□□□□ -0.72
AVL9Q12500 YGR259CYGR259C 441 nt10.53□□□□□ -0.72
AVL9Q12500 DAT1YML113W 747 nt10.53□□□□□ -0.72
AVL9Q12500 YCR102CYCR102C 1107 nt10.5□□□□□ -0.73
AVL9Q12500 BMT6YLR063W 1098 nt10.5□□□□□ -0.73
AVL9Q12500 RPM1RPM1 483 nt10.47□□□□□ -0.73
AVL9Q12500 NBP35YGL091C 987 nt10.45□□□□□ -0.74
AVL9Q12500 AAC1YMR056C 930 nt10.45□□□□□ -0.74
AVL9Q12500 MCH5YOR306C 1566 nt10.43□□□□□ -0.74
AVL9Q12500 MIR1YJR077C 936 nt10.42□□□□□ -0.74
AVL9Q12500 SHB17YKR043C 816 nt10.42□□□□□ -0.74
AVL9Q12500 SNF1YDR477W 1902 nt10.39□□□□□ -0.75
AVL9Q12500 RTN2YDL204W 1182 nt10.38□□□□□ -0.75
AVL9Q12500 YDR010CYDR010C 333 nt10.38□□□□□ -0.75
AVL9Q12500 ALG12YNR030W 1656 nt10.38□□□□□ -0.75
AVL9Q12500 THI74YDR438W 1113 nt10.36□□□□□ -0.75
AVL9Q12500 SHH4YLR164W 507 nt10.35□□□□□ -0.75
AVL9Q12500 UBA4YHR111W 1323 nt10.34□□□□□ -0.75
AVL9Q12500 IRC24YIR036C 792 nt10.34□□□□□ -0.75
AVL9Q12500 NAT4YMR069W 858 nt10.34□□□□□ -0.75
AVL9Q12500 PLB1YMR008C 1995 nt10.33□□□□□ -0.76
AVL9Q12500 PHO89YBR296C 1725 nt10.3□□□□□ -0.76
AVL9Q12500 TIR3YIL011W 810 nt10.3□□□□□ -0.76
AVL9Q12500 BIO5YNR056C 1686 nt10.29□□□□□ -0.76
AVL9Q12500 SFA1YDL168W 1161 nt10.29□□□□□ -0.76
AVL9Q12500 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.29□□□□□ -0.76
AVL9Q12500 ARP6YLR085C 1317 nt10.29□□□□□ -0.76
AVL9Q12500 MSF1YPR047W 1410 nt10.28□□□□□ -0.76
AVL9Q12500 YSR3YKR053C 1215 nt10.28□□□□□ -0.76
AVL9Q12500 RET2YFR051C 1641 nt10.27□□□□□ -0.77
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