Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 ATF2YGR177C 1608 nt9.79□□□□□ -0.84
HMS1Q12398 YLR179CYLR179C 606 nt9.79□□□□□ -0.84
HMS1Q12398 TRM5YHR070W 1500 nt9.77□□□□□ -0.84
HMS1Q12398 ADO1YJR105W 1023 nt9.76□□□□□ -0.85
HMS1Q12398 AQY1YPR192W 918 nt9.76□□□□□ -0.85
HMS1Q12398 WSC2YNL283C 1512 nt9.75□□□□□ -0.85
HMS1Q12398 YFL067WYFL067W 528 nt9.74□□□□□ -0.85
HMS1Q12398 HUA1YGR268C 597 nt9.73□□□□□ -0.85
HMS1Q12398 YFL054CYFL054C 1941 nt9.72□□□□□ -0.85
HMS1Q12398 AHT1YHR093W 549 nt9.72□□□□□ -0.85
HMS1Q12398 MIC10YCL057C-A 294 nt9.7□□□□□ -0.86
HMS1Q12398 SNG1YGR197C 1644 nt9.7□□□□□ -0.86
HMS1Q12398 HEM12YDR047W 1089 nt9.69□□□□□ -0.86
HMS1Q12398 DDR2YOL052C-A 186 nt9.69□□□□□ -0.86
HMS1Q12398 YPR064WYPR064W 420 nt9.69□□□□□ -0.86
HMS1Q12398 SPC25YER018C 666 nt9.67□□□□□ -0.86
HMS1Q12398 STB1YNL309W 1263 nt9.67□□□□□ -0.86
HMS1Q12398 SPT8YLR055C 1809 nt9.66□□□□□ -0.86
HMS1Q12398 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.66□□□□□ -0.86
HMS1Q12398 ANP1YEL036C 1503 nt9.66□□□□□ -0.86
HMS1Q12398 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.65□□□□□ -0.86
HMS1Q12398 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.65□□□□□ -0.86
HMS1Q12398 TAD3YLR316C 969 nt9.64□□□□□ -0.87
HMS1Q12398 GPI16YHR188C 1833 nt9.61□□□□□ -0.87
HMS1Q12398 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.61□□□□□ -0.87
HMS1Q12398 CCT4YDL143W 1587 nt9.6□□□□□ -0.87
HMS1Q12398 HSP60YLR259C 1719 nt9.59□□□□□ -0.87
HMS1Q12398 VPS60YDR486C 690 nt9.59□□□□□ -0.87
HMS1Q12398 FEN2YCR028C 1539 nt9.59□□□□□ -0.87
HMS1Q12398 HSL7YBR133C 2484 nt9.59□□□□□ -0.87
HMS1Q12398 NAR1YNL240C 1476 nt9.55□□□□□ -0.88
HMS1Q12398 ALG3YBL082C 1377 nt9.55□□□□□ -0.88
HMS1Q12398 RAX1YOR301W 1308 nt9.54□□□□□ -0.88
HMS1Q12398 SWE1YJL187C 2460 nt9.54□□□□□ -0.88
HMS1Q12398 BDH1YAL060W 1149 nt9.53□□□□□ -0.88
HMS1Q12398 SWC5YBR231C 912 nt9.53□□□□□ -0.88
HMS1Q12398 YIR016WYIR016W 798 nt9.5□□□□□ -0.89
HMS1Q12398 MIC12YBR262C 321 nt9.5□□□□□ -0.89
HMS1Q12398 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.5□□□□□ -0.89
HMS1Q12398 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.5□□□□□ -0.89
HMS1Q12398 YLR415CYLR415C 339 nt9.47□□□□□ -0.89
HMS1Q12398 BNA2YJR078W 1362 nt9.47□□□□□ -0.89
HMS1Q12398 YSP3YOR003W 1437 nt9.47□□□□□ -0.89
HMS1Q12398 YDR094WYDR094W 336 nt9.44□□□□□ -0.9
HMS1Q12398 CCA1YER168C 1641 nt9.44□□□□□ -0.9
HMS1Q12398 CMP2YML057W 1815 nt9.44□□□□□ -0.9
HMS1Q12398 HEL2YDR266C 1920 nt9.44□□□□□ -0.9
HMS1Q12398 YFR018CYFR018C 1092 nt9.41□□□□□ -0.9
HMS1Q12398 UBX6YJL048C 1191 nt9.4□□□□□ -0.9
HMS1Q12398 PEX25YPL112C 1185 nt9.4□□□□□ -0.9
HMS1Q12398 YNL115CYNL115C 1935 nt9.38□□□□□ -0.91
HMS1Q12398 AGP1YCL025C 1902 nt9.37□□□□□ -0.91
HMS1Q12398 YGR201CYGR201C 678 nt9.35□□□□□ -0.91
HMS1Q12398 PRE6YOL038W 765 nt9.35□□□□□ -0.91
HMS1Q12398 HHO1YPL127C 777 nt9.35□□□□□ -0.91
HMS1Q12398 XDJ1YLR090W 1380 nt9.35□□□□□ -0.91
HMS1Q12398 YFL066CYFL066C 1179 nt9.34□□□□□ -0.91
HMS1Q12398 YAT1YAR035W 2064 nt9.33□□□□□ -0.92
HMS1Q12398 MET2YNL277W 1461 nt9.33□□□□□ -0.92
HMS1Q12398 GLK1YCL040W 1503 nt9.31□□□□□ -0.92
HMS1Q12398 SHM2YLR058C 1410 nt9.31□□□□□ -0.92
HMS1Q12398 TIM17YJL143W 477 nt9.29□□□□□ -0.92
HMS1Q12398 SFP1YLR403W 2052 nt9.28□□□□□ -0.92
HMS1Q12398 VPS75YNL246W 795 nt9.27□□□□□ -0.93
HMS1Q12398 GDH3YAL062W 1374 nt9.26□□□□□ -0.93
HMS1Q12398 PAU16YKL224C 372 nt9.26□□□□□ -0.93
HMS1Q12398 RRT5YFR032C 870 nt9.25□□□□□ -0.93
HMS1Q12398 NIT1YIL164C 600 nt9.24□□□□□ -0.93
HMS1Q12398 NPP1YCR026C 2229 nt9.24□□□□□ -0.93
HMS1Q12398 SSN3YPL042C 1668 nt9.23□□□□□ -0.93
HMS1Q12398 GID7YCL039W 2238 nt9.23□□□□□ -0.93
HMS1Q12398 DUT1YBR252W 444 nt9.23□□□□□ -0.93
HMS1Q12398 FUR4YBR021W 1902 nt9.23□□□□□ -0.93
HMS1Q12398 AVT6YER119C 1347 nt9.22□□□□□ -0.93
HMS1Q12398 PBP1YGR178C 2169 nt9.2□□□□□ -0.94
HMS1Q12398 CYT2YKL087C 675 nt9.19□□□□□ -0.94
HMS1Q12398 SGT2YOR007C 1041 nt9.19□□□□□ -0.94
HMS1Q12398 DUS1YML080W 1272 nt9.18□□□□□ -0.94
HMS1Q12398 GOR1YNL274C 1053 nt9.18□□□□□ -0.94
HMS1Q12398 DAT1YML113W 747 nt9.17□□□□□ -0.94
HMS1Q12398 YCL074WYCL074W 927 nt9.15□□□□□ -0.94
HMS1Q12398 AAC1YMR056C 930 nt9.15□□□□□ -0.94
HMS1Q12398 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.14□□□□□ -0.95
HMS1Q12398 MIR1YJR077C 936 nt9.14□□□□□ -0.95
HMS1Q12398 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.13□□□□□ -0.95
HMS1Q12398 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.13□□□□□ -0.95
HMS1Q12398 STR3YGL184C 1398 nt9.12□□□□□ -0.95
HMS1Q12398 PAU7YAR020C 168 nt9.08□□□□□ -0.96
HMS1Q12398 YCR102CYCR102C 1107 nt9.06□□□□□ -0.96
HMS1Q12398 YDR010CYDR010C 333 nt9.05□□□□□ -0.96
HMS1Q12398 SHB17YKR043C 816 nt9.05□□□□□ -0.96
HMS1Q12398 AQY2YLL052C 450 nt9.05□□□□□ -0.96
HMS1Q12398 HMG2YLR450W 3138 nt9.05□□□□□ -0.96
HMS1Q12398 BIO5YNR056C 1686 nt9.04□□□□□ -0.96
HMS1Q12398 THI74YDR438W 1113 nt9.04□□□□□ -0.96
HMS1Q12398 NBP35YGL091C 987 nt9.03□□□□□ -0.96
HMS1Q12398 NAT4YMR069W 858 nt9.03□□□□□ -0.96
HMS1Q12398 MAE1YKL029C 2010 nt9.03□□□□□ -0.96
HMS1Q12398 YKR005CYKR005C 1578 nt9.03□□□□□ -0.96
HMS1Q12398 PRP4YPR178W 1398 nt9.02□□□□□ -0.97
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